81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1982 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  55.32 
 
 		 803 aa  925    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  76.63 
 
 		 792 aa  1282    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  98.87 
 
 		 795 aa  1644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  100 
 
 		 795 aa  1662    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  96.86 
 
 		 795 aa  1576    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  43.99 
 
 		 765 aa  709    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  47.48 
 
 		 844 aa  687    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  45.1 
 
 		 760 aa  706    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  41.08 
 
 		 744 aa  511  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  42.69 
 
 		 641 aa  510  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11690  hypothetical protein  38.42 
 
 		 752 aa  508  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  39.37 
 
 		 749 aa  503  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  33.04 
 
 		 783 aa  413  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  31.27 
 
 		 955 aa  340  5e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  35.45 
 
 		 614 aa  335  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  33.76 
 
 		 846 aa  335  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  33.44 
 
 		 771 aa  329  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  30.81 
 
 		 1025 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  29.83 
 
 		 881 aa  223  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0997  protein of unknown function DUF1680  27.24 
 
 		 597 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  25.04 
 
 		 607 aa  144  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1859  protein of unknown function DUF1680  28.1 
 
 		 736 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  23.78 
 
 		 602 aa  127  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  25.47 
 
 		 634 aa  110  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  23.35 
 
 		 596 aa  110  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  23.01 
 
 		 711 aa  107  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  29.86 
 
 		 686 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  23.06 
 
 		 656 aa  104  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  21.63 
 
 		 655 aa  104  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  25.96 
 
 		 640 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  24.76 
 
 		 648 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  25.6 
 
 		 800 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  24.06 
 
 		 680 aa  99  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  22.25 
 
 		 652 aa  96.3  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  23.09 
 
 		 665 aa  88.2  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  22.43 
 
 		 666 aa  87.4  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  21.32 
 
 		 659 aa  87  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  22.7 
 
 		 640 aa  84.7  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  25.87 
 
 		 651 aa  84.7  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  25.52 
 
 		 651 aa  84.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  25.52 
 
 		 651 aa  84.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  23.57 
 
 		 640 aa  83.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  25.52 
 
 		 651 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  25.52 
 
 		 651 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  24.83 
 
 		 656 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  23.58 
 
 		 638 aa  83.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  25.17 
 
 		 656 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  22.28 
 
 		 672 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  21.89 
 
 		 640 aa  82.4  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549846 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  22.17 
 
 		 659 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  22.42 
 
 		 673 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  24.41 
 
 		 634 aa  80.5  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  22.04 
 
 		 667 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  27.65 
 
 		 636 aa  80.1  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  23.27 
 
 		 654 aa  79.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  22.3 
 
 		 648 aa  79  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  24.34 
 
 		 679 aa  77  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  21.86 
 
 		 643 aa  76.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  24.9 
 
 		 646 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  22.66 
 
 		 617 aa  72.8  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  21.74 
 
 		 620 aa  70.5  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  22.32 
 
 		 620 aa  70.5  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  22.17 
 
 		 652 aa  68.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  23.05 
 
 		 647 aa  68.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  21.91 
 
 		 684 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  23.17 
 
 		 628 aa  67.4  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  24.58 
 
 		 667 aa  65.1  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  20.7 
 
 		 647 aa  64.7  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  21.5 
 
 		 742 aa  62.4  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  20.1 
 
 		 629 aa  62.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05305  DUF1680 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08910)  22.27 
 
 		 629 aa  62.4  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  23.02 
 
 		 675 aa  60.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  21.79 
 
 		 684 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  26.63 
 
 		 669 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  23.81 
 
 		 678 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  33.61 
 
 		 838 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  22.87 
 
 		 633 aa  55.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  24.65 
 
 		 963 aa  54.7  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  22.48 
 
 		 677 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  18.5 
 
 		 648 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3545  hypothetical protein  24.46 
 
 		 663 aa  45.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>