77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3876 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  43.54 
 
 		 792 aa  702    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.23 
 
 		 803 aa  744    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  45.97 
 
 		 844 aa  683    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  68.06 
 
 		 760 aa  1110    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  44.39 
 
 		 795 aa  708    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  44.17 
 
 		 795 aa  709    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.52 
 
 		 795 aa  707    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  100 
 
 		 765 aa  1592    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  38.07 
 
 		 744 aa  540  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  35.7 
 
 		 749 aa  510  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11690  hypothetical protein  37.54 
 
 		 752 aa  498  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  41.56 
 
 		 641 aa  486  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  32.4 
 
 		 783 aa  405  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  32.62 
 
 		 955 aa  332  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  30.19 
 
 		 771 aa  321  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  33.83 
 
 		 846 aa  317  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  33.44 
 
 		 614 aa  311  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  31.75 
 
 		 1025 aa  274  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  26.59 
 
 		 881 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0997  protein of unknown function DUF1680  26.56 
 
 		 597 aa  202  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  26.3 
 
 		 607 aa  144  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  23.14 
 
 		 602 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  23.4 
 
 		 596 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  22.86 
 
 		 652 aa  125  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1859  protein of unknown function DUF1680  26.6 
 
 		 736 aa  122  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  24.6 
 
 		 655 aa  114  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  22.86 
 
 		 636 aa  107  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  24.54 
 
 		 680 aa  107  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  24.17 
 
 		 634 aa  106  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  23 
 
 		 673 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  22.49 
 
 		 648 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  24.17 
 
 		 800 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  21.1 
 
 		 640 aa  99.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  22.73 
 
 		 634 aa  96.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  21.09 
 
 		 638 aa  97.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  22.64 
 
 		 620 aa  95.1  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  20.89 
 
 		 648 aa  94.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  22.95 
 
 		 620 aa  92.4  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  22.63 
 
 		 684 aa  90.5  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  22.11 
 
 		 640 aa  90.9  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  22.49 
 
 		 617 aa  89.7  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  22.66 
 
 		 686 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  23.71 
 
 		 656 aa  89  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  21.99 
 
 		 654 aa  86.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  23.57 
 
 		 646 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  22.77 
 
 		 666 aa  85.9  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  20.53 
 
 		 640 aa  84.3  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  18.62 
 
 		 640 aa  82.8  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  21.96 
 
 		 672 aa  83.2  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  19.79 
 
 		 651 aa  80.9  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  20.58 
 
 		 711 aa  80.1  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  19.58 
 
 		 651 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  19.58 
 
 		 651 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  19.58 
 
 		 651 aa  80.1  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  19.58 
 
 		 651 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  23.86 
 
 		 679 aa  79  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  19.51 
 
 		 667 aa  77.8  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  19.51 
 
 		 659 aa  78.2  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  19.51 
 
 		 656 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  19.41 
 
 		 659 aa  76.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  19.26 
 
 		 656 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  19.46 
 
 		 665 aa  74.3  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  20.67 
 
 		 647 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0294245 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05305  DUF1680 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08910)  24.78 
 
 		 629 aa  70.9  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  19.72 
 
 		 652 aa  68.2  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  20 
 
 		 648 aa  64.7  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  20.65 
 
 		 633 aa  63.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  19.87 
 
 		 628 aa  62.4  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  21.43 
 
 		 684 aa  61.2  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  18.63 
 
 		 647 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  21.9 
 
 		 675 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  20.22 
 
 		 643 aa  58.9  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  23.02 
 
 		 963 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  29.75 
 
 		 838 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0057  protein of unknown function DUF1680  20 
 
 		 643 aa  48.1  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0839925 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  19.32 
 
 		 742 aa  47.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  22.94 
 
 		 669 aa  44.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>