179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4995 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  100 
 
 
1016 aa  2031    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  27.82 
 
 
2375 aa  242  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.92 
 
 
815 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  57.8 
 
 
674 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  78.48 
 
 
688 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0136  Ig family protein  67.78 
 
 
622 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.75 
 
 
756 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  59.05 
 
 
672 aa  97.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  43.36 
 
 
943 aa  95.9  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  39.81 
 
 
824 aa  95.5  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  63.83 
 
 
884 aa  93.6  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  39.72 
 
 
748 aa  92.8  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  57.29 
 
 
933 aa  92.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  69.77 
 
 
726 aa  92  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  40.62 
 
 
461 aa  91.3  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  43.28 
 
 
401 aa  89.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  43.61 
 
 
535 aa  88.2  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.51 
 
 
962 aa  87.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  41.22 
 
 
374 aa  87.4  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  55.32 
 
 
1072 aa  87.4  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  36.69 
 
 
806 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  36.69 
 
 
806 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  36.69 
 
 
806 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  34.76 
 
 
436 aa  85.5  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  38 
 
 
492 aa  85.1  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.07 
 
 
476 aa  85.1  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  37.04 
 
 
737 aa  84.7  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  36.55 
 
 
803 aa  84.7  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  41.27 
 
 
489 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  36.23 
 
 
806 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  36.23 
 
 
806 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  36.23 
 
 
806 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  36.23 
 
 
806 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  38.35 
 
 
368 aa  83.2  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  52.75 
 
 
1338 aa  82.4  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  41.09 
 
 
451 aa  82.8  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  61.96 
 
 
788 aa  82.8  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.75 
 
 
1321 aa  82.4  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.72 
 
 
507 aa  82.4  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.59 
 
 
474 aa  82  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  37.66 
 
 
806 aa  81.6  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  35.94 
 
 
497 aa  81.3  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  33.74 
 
 
801 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  31.08 
 
 
1000 aa  78.6  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  38.28 
 
 
380 aa  79  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  35.37 
 
 
494 aa  78.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  38.35 
 
 
618 aa  78.2  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  36.36 
 
 
474 aa  78.2  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1270  Ig family protein  65.22 
 
 
753 aa  78.2  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902068  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  35.94 
 
 
468 aa  78.2  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  35.94 
 
 
472 aa  77.8  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  36.09 
 
 
558 aa  77.4  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  48.28 
 
 
778 aa  77.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35.94 
 
 
493 aa  76.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  32.89 
 
 
490 aa  76.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  47.73 
 
 
498 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  37.19 
 
 
691 aa  75.9  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  58.23 
 
 
710 aa  75.5  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  62.77 
 
 
1148 aa  75.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  35.51 
 
 
603 aa  74.3  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  31.71 
 
 
547 aa  74.3  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35.16 
 
 
500 aa  74.3  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  39.58 
 
 
794 aa  73.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  37.8 
 
 
469 aa  73.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.05 
 
 
466 aa  72.8  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  41.38 
 
 
482 aa  72.4  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  35.77 
 
 
801 aa  70.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  58.82 
 
 
3244 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  35.88 
 
 
489 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  33.33 
 
 
957 aa  69.7  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  34.62 
 
 
563 aa  68.9  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  34.88 
 
 
479 aa  69.3  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 
495 aa  68.9  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  37.4 
 
 
568 aa  68.6  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  33.88 
 
 
1259 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  33.08 
 
 
240 aa  67.8  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.57 
 
 
514 aa  66.6  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  30.47 
 
 
1567 aa  66.6  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  31.72 
 
 
427 aa  67  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5658  Ricin B lectin  48.98 
 
 
840 aa  67  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.36 
 
 
507 aa  66.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  36.97 
 
 
884 aa  66.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  61.64 
 
 
2079 aa  66.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1731  Ricin B lectin  26.9 
 
 
172 aa  65.5  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  33.88 
 
 
1222 aa  65.9  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  34.66 
 
 
430 aa  65.1  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  31.29 
 
 
503 aa  64.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  32.21 
 
 
801 aa  64.3  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  54.65 
 
 
1779 aa  63.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  25.9 
 
 
1100 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  34.23 
 
 
493 aa  63.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  40.24 
 
 
589 aa  62.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  28.74 
 
 
165 aa  62.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.58 
 
 
520 aa  62.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  33.96 
 
 
672 aa  62.4  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2202  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.15 
 
 
597 aa  62.4  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176046  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  37.18 
 
 
548 aa  62.4  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  29.73 
 
 
411 aa  62.4  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  33.07 
 
 
487 aa  62.4  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  65.33 
 
 
518 aa  62.4  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>