294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2992 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  100 
 
 		 982 aa  2024    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  56.31 
 
 		 863 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  34.92 
 
 		 472 aa  227  9e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.71 
 
 		 627 aa  219  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  32.14 
 
 		 648 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  32.53 
 
 		 497 aa  212  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  32.24 
 
 		 488 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.18 
 
 		 484 aa  201  5e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.96 
 
 		 505 aa  198  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  31.9 
 
 		 480 aa  191  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  32 
 
 		 666 aa  188  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.3 
 
 		 486 aa  188  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  32.46 
 
 		 445 aa  181  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  32.15 
 
 		 485 aa  181  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  29.11 
 
 		 475 aa  176  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.33 
 
 		 514 aa  174  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  38.89 
 
 		 610 aa  172  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  29.6 
 
 		 446 aa  165  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.86 
 
 		 603 aa  164  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  28.12 
 
 		 634 aa  164  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  26.9 
 
 		 484 aa  162  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  27.39 
 
 		 487 aa  158  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  34.16 
 
 		 954 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  34.48 
 
 		 918 aa  156  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  28.18 
 
 		 476 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  34.8 
 
 		 630 aa  154  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  27.99 
 
 		 647 aa  153  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.72 
 
 		 695 aa  154  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  36.04 
 
 		 673 aa  152  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.95 
 
 		 474 aa  152  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  28.67 
 
 		 481 aa  151  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  28.88 
 
 		 485 aa  150  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  25.05 
 
 		 501 aa  147  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  35.17 
 
 		 569 aa  141  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  31.95 
 
 		 1391 aa  140  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  36.9 
 
 		 877 aa  140  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  35.69 
 
 		 1167 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  28.03 
 
 		 526 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  31.37 
 
 		 1707 aa  135  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  32.1 
 
 		 603 aa  135  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  47.83 
 
 		 1132 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  27.95 
 
 		 481 aa  129  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  26.79 
 
 		 487 aa  125  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  29.22 
 
 		 1799 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  24.86 
 
 		 567 aa  121  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  41.18 
 
 		 524 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  28.95 
 
 		 1234 aa  118  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  27.5 
 
 		 447 aa  118  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  38.95 
 
 		 801 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  25.61 
 
 		 447 aa  117  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.93 
 
 		 1321 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  28.4 
 
 		 930 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  28.96 
 
 		 1262 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  37.21 
 
 		 705 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  47.24 
 
 		 639 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  25.23 
 
 		 445 aa  113  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  28.47 
 
 		 2073 aa  112  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  44.8 
 
 		 869 aa  112  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  26.22 
 
 		 445 aa  110  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  27.93 
 
 		 1035 aa  110  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  26.56 
 
 		 441 aa  110  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  26.43 
 
 		 1338 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  33.82 
 
 		 1091 aa  108  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  47.54 
 
 		 389 aa  108  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  36.99 
 
 		 581 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  31.09 
 
 		 948 aa  105  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  40.97 
 
 		 739 aa  104  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  45.9 
 
 		 884 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  34.76 
 
 		 500 aa  102  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  41.98 
 
 		 726 aa  101  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.67 
 
 		 933 aa  101  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  43.17 
 
 		 823 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  42.86 
 
 		 957 aa  100  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  39.29 
 
 		 798 aa  100  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  44.26 
 
 		 541 aa  99.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  35.47 
 
 		 1139 aa  99  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  42.45 
 
 		 819 aa  98.2  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  43.44 
 
 		 536 aa  97.8  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  42.45 
 
 		 870 aa  97.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  33.95 
 
 		 919 aa  97.4  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  36.67 
 
 		 465 aa  96.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  42.66 
 
 		 840 aa  96.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  28.36 
 
 		 855 aa  96.3  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  47.37 
 
 		 461 aa  95.1  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  41.01 
 
 		 1356 aa  94.7  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  28.42 
 
 		 618 aa  94.4  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  40.25 
 
 		 735 aa  94.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  39.22 
 
 		 468 aa  93.6  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  39.69 
 
 		 853 aa  93.6  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  35.64 
 
 		 627 aa  93.6  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  42.25 
 
 		 1732 aa  92.8  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  39.86 
 
 		 2554 aa  91.7  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  34.23 
 
 		 550 aa  91.3  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  40.29 
 
 		 411 aa  91.3  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  28.34 
 
 		 1295 aa  90.5  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  32.6 
 
 		 1024 aa  89.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  38.73 
 
 		 845 aa  90.1  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  36.62 
 
 		 1387 aa  90.1  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  39.69 
 
 		 503 aa  89.7  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  39.57 
 
 		 777 aa  90.1  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>