122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2054 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2054  Ricin B lectin  100 
 
 
459 aa  892    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  40.18 
 
 
461 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  35.77 
 
 
469 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  38.1 
 
 
567 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  39.29 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  36.67 
 
 
468 aa  70.5  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  39.09 
 
 
493 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 
674 aa  67.8  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.94 
 
 
498 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  36.36 
 
 
451 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  34.71 
 
 
275 aa  67  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  39.29 
 
 
490 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  37.84 
 
 
801 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  39.78 
 
 
535 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  38.35 
 
 
568 aa  66.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.9 
 
 
489 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  35.71 
 
 
374 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  35 
 
 
497 aa  63.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  33.33 
 
 
492 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  31.86 
 
 
589 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  33.03 
 
 
368 aa  63.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  31.25 
 
 
489 aa  63.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  34.68 
 
 
603 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  36.27 
 
 
380 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 
528 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  32.79 
 
 
548 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  33.88 
 
 
373 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  35.19 
 
 
801 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  33.04 
 
 
558 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 
422 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 
468 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  34.13 
 
 
165 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.71 
 
 
1072 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  32.11 
 
 
547 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4576  serine/threonine protein kinase  36.79 
 
 
556 aa  57.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0563383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  30.05 
 
 
382 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 
776 aa  57.4  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 
391 aa  57  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0726  serine/threonine protein kinase  32.24 
 
 
556 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35.14 
 
 
500 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.35 
 
 
933 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  32.26 
 
 
377 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5094  serine/threonine protein kinase  39.02 
 
 
535 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  34.55 
 
 
426 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
525 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 
563 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 
534 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  33.33 
 
 
801 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  35.71 
 
 
479 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  33.33 
 
 
803 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.93 
 
 
580 aa  53.9  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.03 
 
 
532 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3106  serine/threonine protein kinase  31.11 
 
 
538 aa  53.9  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0027  serine/threonine protein kinase  27.75 
 
 
473 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  30.94 
 
 
503 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  29.36 
 
 
634 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1541  hypothetical protein  34.84 
 
 
443 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.907452  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.43 
 
 
446 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 
631 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  28.57 
 
 
436 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 
419 aa  50.8  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  34.15 
 
 
488 aa  51.2  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  34.57 
 
 
468 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  37.21 
 
 
1128 aa  50.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4151  Ricin B lectin  32.88 
 
 
320 aa  50.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  30.52 
 
 
583 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  30.32 
 
 
562 aa  50.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  36.71 
 
 
709 aa  50.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  30.83 
 
 
516 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 
461 aa  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4540  serine/threonine protein kinase  31.88 
 
 
444 aa  50.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.261532  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.61 
 
 
647 aa  50.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  31.01 
 
 
644 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  27.07 
 
 
668 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  36.63 
 
 
522 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3516  serine/threonine protein kinase  33.54 
 
 
481 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  29.85 
 
 
494 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  30.77 
 
 
417 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 
703 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  33.02 
 
 
384 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  30.4 
 
 
627 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04830  serine/threonine protein kinase  35.34 
 
 
316 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0435462  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 
642 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  27.46 
 
 
1032 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 
766 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2069  serine/threonine protein kinase  31.61 
 
 
501 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.832371  normal  0.49505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  29.21 
 
 
638 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  34.31 
 
 
452 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2136  serine/threonine protein kinase  31.99 
 
 
660 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701308  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
705 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  29.56 
 
 
450 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  28.88 
 
 
675 aa  47.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.11 
 
 
531 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  31.82 
 
 
492 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  33.13 
 
 
345 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2556  Ricin B lectin  36.59 
 
 
382 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.676304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  33.06 
 
 
732 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2236  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.78 
 
 
535 aa  47  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00978741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.99 
 
 
521 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>