42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4151 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4151  Ricin B lectin  100 
 
 		 320 aa  651    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4149  Ricin B lectin  47.93 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.255794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4150  Ricin B lectin  44.94 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2556  Ricin B lectin  46.84 
 
 		 382 aa  185  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.676304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  36.11 
 
 		 382 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3769  Ricin B lectin  36.19 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  31.19 
 
 		 493 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  28.1 
 
 		 801 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  30.95 
 
 		 498 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  30.97 
 
 		 472 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.07 
 
 		 489 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  30.37 
 
 		 469 aa  52.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  30.09 
 
 		 490 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  31.78 
 
 		 492 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2054  Ricin B lectin  35.38 
 
 		 459 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  30.84 
 
 		 451 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  31.39 
 
 		 568 aa  49.7  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  30.7 
 
 		 589 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  29.37 
 
 		 497 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  27.52 
 
 		 558 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  30.56 
 
 		 548 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  29.93 
 
 		 479 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  38.2 
 
 		 5166 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  28.18 
 
 		 374 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  26.67 
 
 		 801 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  27.27 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  31.85 
 
 		 489 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  25.64 
 
 		 476 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  26.15 
 
 		 603 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30 
 
 		 1072 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  27.98 
 
 		 417 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  28.7 
 
 		 500 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  32.54 
 
 		 2990 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  33.93 
 
 		 5517 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  27.91 
 
 		 461 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  30.38 
 
 		 468 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  28.68 
 
 		 803 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  27.78 
 
 		 547 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  21.89 
 
 		 503 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  32.79 
 
 		 1519 aa  42.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  29.6 
 
 		 380 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  28.26 
 
 		 5544 aa  42.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>