77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2556 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2556  Ricin B lectin  100 
 
 		 382 aa  758    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.676304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3769  Ricin B lectin  41.12 
 
 		 400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4151  Ricin B lectin  45.63 
 
 		 320 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4149  Ricin B lectin  45.49 
 
 		 320 aa  189  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.255794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  38.48 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4150  Ricin B lectin  35.31 
 
 		 333 aa  170  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  34.88 
 
 		 3373 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  38.69 
 
 		 568 aa  66.6  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  32.14 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  33.14 
 
 		 5203 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  33.14 
 
 		 5166 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  31.46 
 
 		 1337 aa  60.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  31.46 
 
 		 1337 aa  60.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  28.37 
 
 		 733 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2703  Cna B domain protein  31.15 
 
 		 586 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000547211  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  31.76 
 
 		 2047 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  31.11 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  32.37 
 
 		 567 aa  56.2  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  30.05 
 
 		 2604 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  29.95 
 
 		 965 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  29.95 
 
 		 965 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4196  conserved repeat domain protein  30.52 
 
 		 666 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00838745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  29.08 
 
 		 469 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1727 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  30.51 
 
 		 1153 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  30.51 
 
 		 1153 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  38.1 
 
 		 803 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  28.04 
 
 		 240 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  29.24 
 
 		 589 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  36.67 
 
 		 1041 aa  50.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  36.09 
 
 		 497 aa  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  25.76 
 
 		 503 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  33.65 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  29.35 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.7 
 
 		 933 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  29.93 
 
 		 239 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  35.19 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 489 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30 
 
 		 1072 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  29.86 
 
 		 368 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  31.12 
 
 		 1243 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  28.57 
 
 		 494 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.36 
 
 		 476 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  31.37 
 
 		 801 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  29.1 
 
 		 1263 aa  47  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2054  Ricin B lectin  36.59 
 
 		 459 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  31.88 
 
 		 165 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  29.1 
 
 		 5517 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  31.5 
 
 		 548 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  25.55 
 
 		 558 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  31.43 
 
 		 709 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  26.81 
 
 		 2656 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  29.14 
 
 		 801 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  28.46 
 
 		 516 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  30.22 
 
 		 535 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0868  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  39.19 
 
 		 456 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  29.01 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  27.91 
 
 		 451 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  28.57 
 
 		 490 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  25.86 
 
 		 2876 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  31.47 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  29.81 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  25.77 
 
 		 492 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1624  ABC-type sugar transport systems permease components-like protein  39.08 
 
 		 503 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180215  normal  0.289287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  30.63 
 
 		 380 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  27.5 
 
 		 2890 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  29.55 
 
 		 472 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  26 
 
 		 892 aa  43.9  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  36.67 
 
 		 3324 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  28.46 
 
 		 498 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  29.37 
 
 		 634 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  26.56 
 
 		 474 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  27.32 
 
 		 493 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  28.87 
 
 		 890 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  26.97 
 
 		 427 aa  43.1  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.71 
 
 		 489 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1537 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>