54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4149 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4149  Ricin B lectin  100 
 
 		 320 aa  650    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.255794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4151  Ricin B lectin  48.32 
 
 		 320 aa  269  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4150  Ricin B lectin  43.07 
 
 		 333 aa  218  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2556  Ricin B lectin  42.63 
 
 		 382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.676304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  41.63 
 
 		 382 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3769  Ricin B lectin  38.08 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  32.68 
 
 		 801 aa  62.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  28.77 
 
 		 493 aa  62.4  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  32.67 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  31.58 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35.11 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  30.96 
 
 		 498 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  33.1 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  33.58 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  36.97 
 
 		 1519 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  33.1 
 
 		 589 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  32.19 
 
 		 548 aa  56.2  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  30.66 
 
 		 803 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  36.45 
 
 		 3373 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  30.47 
 
 		 801 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  31.13 
 
 		 801 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  28.99 
 
 		 451 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  31.11 
 
 		 492 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  32.59 
 
 		 380 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  41.98 
 
 		 1727 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  28.15 
 
 		 374 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  37.5 
 
 		 5166 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  31.06 
 
 		 2990 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  29.46 
 
 		 468 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  30.77 
 
 		 452 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  26.29 
 
 		 494 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  32.06 
 
 		 732 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.99 
 
 		 1072 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  31.78 
 
 		 417 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  25 
 
 		 503 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  30 
 
 		 535 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  31.88 
 
 		 567 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2054  Ricin B lectin  40 
 
 		 459 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  28.57 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  29.77 
 
 		 446 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  31.01 
 
 		 489 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  30.86 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.34 
 
 		 815 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  33.78 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  28.78 
 
 		 644 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  31.25 
 
 		 1337 aa  43.5  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  29.03 
 
 		 497 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  29.73 
 
 		 368 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  31.25 
 
 		 1337 aa  43.5  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  27.69 
 
 		 634 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  29.8 
 
 		 5203 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  31.62 
 
 		 568 aa  43.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  28.57 
 
 		 558 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 		 5517 aa  42.7  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>