84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2828 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  100 
 
 		 510 aa  1017    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  39.32 
 
 		 484 aa  269  8e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  42.55 
 
 		 679 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  35.67 
 
 		 552 aa  228  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  35.37 
 
 		 552 aa  224  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  33.7 
 
 		 505 aa  203  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 		 562 aa  192  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  37.07 
 
 		 782 aa  190  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  32.26 
 
 		 429 aa  189  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  32.57 
 
 		 555 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  29.29 
 
 		 589 aa  166  8e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  34.76 
 
 		 579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  35.33 
 
 		 579 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  33.66 
 
 		 578 aa  157  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  31.07 
 
 		 1020 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  30.66 
 
 		 824 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  29.03 
 
 		 713 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  28.64 
 
 		 740 aa  67.4  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  31.25 
 
 		 723 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  31.25 
 
 		 736 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  33.12 
 
 		 727 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 		 718 aa  64.7  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.86 
 
 		 684 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  31.32 
 
 		 694 aa  62  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  27.15 
 
 		 739 aa  61.6  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  26.49 
 
 		 700 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  29.14 
 
 		 726 aa  58.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  29.51 
 
 		 726 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  27.84 
 
 		 716 aa  58.2  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  31.63 
 
 		 728 aa  58.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  30.26 
 
 		 729 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  30.94 
 
 		 715 aa  58.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  28.57 
 
 		 747 aa  57.4  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  29.02 
 
 		 701 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  24.69 
 
 		 722 aa  56.2  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  30 
 
 		 765 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  30.62 
 
 		 794 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  28.41 
 
 		 723 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  28.18 
 
 		 760 aa  55.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4334  glycoside hydrolase family protein  28.28 
 
 		 616 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  28.49 
 
 		 530 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  33.96 
 
 		 733 aa  54.7  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  27.15 
 
 		 818 aa  54.7  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  27.96 
 
 		 765 aa  54.3  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.12 
 
 		 718 aa  54.3  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  31.52 
 
 		 721 aa  53.9  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  27.81 
 
 		 729 aa  53.9  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  27.04 
 
 		 734 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  25 
 
 		 729 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0843  glycosy hydrolase family protein  27.86 
 
 		 502 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00330381  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  27 
 
 		 730 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  28.06 
 
 		 774 aa  52.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  26.29 
 
 		 708 aa  51.2  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  26.29 
 
 		 708 aa  51.2  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  26.29 
 
 		 708 aa  51.2  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  27 
 
 		 734 aa  51.2  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  26.37 
 
 		 740 aa  50.4  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  26.47 
 
 		 730 aa  50.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  25.64 
 
 		 743 aa  50.1  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  29 
 
 		 733 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  26.5 
 
 		 729 aa  48.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  30.65 
 
 		 732 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  31.48 
 
 		 730 aa  47.4  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  23.17 
 
 		 727 aa  47  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0259  glycoside hydrolase family 31  28.19 
 
 		 631 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0820064 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5646  hypothetical protein  29.77 
 
 		 666 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  28.42 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  24.41 
 
 		 799 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.86 
 
 		 729 aa  46.2  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  27.75 
 
 		 768 aa  46.2  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  28 
 
 		 713 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  30.29 
 
 		 579 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1469  glycoside hydrolase family 31  28.47 
 
 		 527 aa  45.8  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000732278  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  26.73 
 
 		 757 aa  46.2  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  30.92 
 
 		 704 aa  45.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  27.46 
 
 		 709 aa  45.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  29.17 
 
 		 726 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  27.17 
 
 		 724 aa  44.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  29.37 
 
 		 709 aa  44.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  27.22 
 
 		 724 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  29.78 
 
 		 733 aa  44.3  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  26.15 
 
 		 722 aa  44.3  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.71 
 
 		 735 aa  43.9  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  27.46 
 
 		 795 aa  43.1  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>