108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51410 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  100 
 
 		 733 aa  1491    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  43.96 
 
 		 701 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  41.09 
 
 		 736 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  42.88 
 
 		 728 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  41.09 
 
 		 723 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  37.68 
 
 		 708 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  37.82 
 
 		 708 aa  474  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  37.82 
 
 		 708 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  37.52 
 
 		 718 aa  464  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  39.52 
 
 		 714 aa  449  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  37.57 
 
 		 707 aa  444  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  36.85 
 
 		 700 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  39.1 
 
 		 714 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  40.2 
 
 		 709 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  39.59 
 
 		 709 aa  437  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  37.85 
 
 		 727 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  36.71 
 
 		 708 aa  421  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  36.71 
 
 		 708 aa  421  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  39.36 
 
 		 715 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  39.05 
 
 		 733 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  36.78 
 
 		 707 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  37.33 
 
 		 724 aa  388  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  35.9 
 
 		 722 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  35.8 
 
 		 719 aa  381  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  38.26 
 
 		 724 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  36.68 
 
 		 730 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  37.25 
 
 		 747 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  41.02 
 
 		 699 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  35.29 
 
 		 735 aa  375  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  36.78 
 
 		 723 aa  369  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  38.45 
 
 		 721 aa  366  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  35.37 
 
 		 740 aa  364  3e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  37.33 
 
 		 726 aa  360  4e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  32.52 
 
 		 729 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  36.43 
 
 		 704 aa  350  5e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  37.09 
 
 		 747 aa  348  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  35.3 
 
 		 718 aa  349  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  36.47 
 
 		 688 aa  346  7e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  32.85 
 
 		 726 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  36.23 
 
 		 726 aa  333  8e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  35.16 
 
 		 729 aa  332  2e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  35.7 
 
 		 733 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  36.84 
 
 		 701 aa  327  7e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  33.92 
 
 		 729 aa  326  8.000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  34.42 
 
 		 729 aa  326  8.000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  34.04 
 
 		 722 aa  326  8.000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  35.49 
 
 		 729 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  37.18 
 
 		 740 aa  324  3e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  33.71 
 
 		 739 aa  325  3e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  35.81 
 
 		 743 aa  323  6e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  31.52 
 
 		 730 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  31.47 
 
 		 734 aa  318  3e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  33.16 
 
 		 768 aa  316  8e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  35.56 
 
 		 699 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  35.68 
 
 		 734 aa  314  3.9999999999999997e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  33.81 
 
 		 750 aa  307  5.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  33.45 
 
 		 774 aa  306  1.0000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  38.17 
 
 		 818 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  29.7 
 
 		 713 aa  293  1e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  33.17 
 
 		 730 aa  290  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  29.64 
 
 		 726 aa  264  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  33.21 
 
 		 716 aa  259  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  33.04 
 
 		 713 aa  259  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  33.16 
 
 		 727 aa  247  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  30.57 
 
 		 684 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  31.23 
 
 		 530 aa  134  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.72 
 
 		 683 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  29.02 
 
 		 657 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  25.81 
 
 		 732 aa  101  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.1 
 
 		 674 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  29.45 
 
 		 675 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  28.57 
 
 		 706 aa  89.4  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  29.17 
 
 		 679 aa  87  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  27.42 
 
 		 723 aa  85.1  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  24.74 
 
 		 669 aa  79  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  24.81 
 
 		 700 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  30.77 
 
 		 484 aa  74.3  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  25.41 
 
 		 579 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  26.32 
 
 		 579 aa  68.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  28.86 
 
 		 552 aa  63.9  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  28.86 
 
 		 552 aa  63.9  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  28.21 
 
 		 562 aa  63.5  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  28.34 
 
 		 578 aa  63.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  32.48 
 
 		 1020 aa  58.2  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 548 aa  58.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  28.3 
 
 		 555 aa  56.6  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  30.67 
 
 		 589 aa  57  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  27.39 
 
 		 505 aa  57  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  29.51 
 
 		 429 aa  56.6  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  28.03 
 
 		 824 aa  55.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  29.66 
 
 		 782 aa  55.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  33.96 
 
 		 510 aa  54.7  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  25 
 
 		 579 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  35.11 
 
 		 411 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  32.32 
 
 		 597 aa  52  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0375  hypothetical protein  29.93 
 
 		 700 aa  51.2  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  29.45 
 
 		 679 aa  50.8  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 568 aa  50.8  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.32 
 
 		 684 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  31.82 
 
 		 471 aa  48.5  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>