77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50372 on replicon NC_011697
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  100 
 
 
1020 aa  2127    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  36.19 
 
 
679 aa  198  4.0000000000000005e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  28.17 
 
 
782 aa  189  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  31.36 
 
 
552 aa  162  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  31.07 
 
 
552 aa  160  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  37.4 
 
 
589 aa  157  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  33.55 
 
 
562 aa  155  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  30.79 
 
 
555 aa  152  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.07 
 
 
510 aa  145  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  31.72 
 
 
484 aa  139  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  31.22 
 
 
505 aa  122  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  27.88 
 
 
578 aa  116  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  30.3 
 
 
429 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  25.54 
 
 
579 aa  103  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  23.96 
 
 
579 aa  104  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  24.85 
 
 
824 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  33.66 
 
 
818 aa  61.6  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  30 
 
 
684 aa  61.6  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  29.31 
 
 
743 aa  60.8  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  27.59 
 
 
739 aa  60.1  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  30.77 
 
 
768 aa  59.7  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  28.99 
 
 
729 aa  58.9  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  28.08 
 
 
727 aa  58.5  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  29.31 
 
 
723 aa  58.9  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  30.77 
 
 
708 aa  58.5  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.65 
 
 
684 aa  58.5  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  30.77 
 
 
708 aa  58.2  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  29.05 
 
 
733 aa  58.2  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.33 
 
 
683 aa  58.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  30.77 
 
 
708 aa  58.5  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  41.27 
 
 
700 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  29.91 
 
 
713 aa  56.6  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  31.96 
 
 
709 aa  56.6  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  29.36 
 
 
716 aa  56.2  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  29.75 
 
 
709 aa  55.1  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  32.76 
 
 
715 aa  54.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.98 
 
 
718 aa  54.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  28.57 
 
 
530 aa  53.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.19 
 
 
699 aa  53.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  29.91 
 
 
701 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  29.7 
 
 
714 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  30.3 
 
 
708 aa  53.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  30.3 
 
 
708 aa  53.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  28.74 
 
 
701 aa  52.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  28.78 
 
 
733 aa  52  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  25.9 
 
 
721 aa  52  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  27.72 
 
 
704 aa  51.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  27.72 
 
 
714 aa  50.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  23.26 
 
 
740 aa  51.2  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.7 
 
 
700 aa  51.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  28.18 
 
 
730 aa  51.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  26 
 
 
734 aa  50.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  25.68 
 
 
718 aa  50.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  26.72 
 
 
730 aa  50.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  35.62 
 
 
726 aa  49.7  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  26.09 
 
 
730 aa  49.7  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  27.17 
 
 
727 aa  48.5  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  26.5 
 
 
722 aa  48.5  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  25.64 
 
 
699 aa  48.5  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  26.72 
 
 
747 aa  48.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  25 
 
 
726 aa  48.1  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  33.02 
 
 
694 aa  48.5  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  28.57 
 
 
774 aa  47.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.86 
 
 
688 aa  47.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  28.81 
 
 
722 aa  47  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.27 
 
 
735 aa  47  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  27.62 
 
 
726 aa  47.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  25 
 
 
729 aa  47  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  29.66 
 
 
728 aa  46.2  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  27.45 
 
 
657 aa  45.8  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.36 
 
 
707 aa  46.2  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.86 
 
 
733 aa  45.8  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  29.61 
 
 
736 aa  45.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  29.61 
 
 
723 aa  45.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  25.86 
 
 
734 aa  45.4  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  28.81 
 
 
724 aa  45.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  32.89 
 
 
726 aa  45.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>