90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1181 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  99.72 
 
 
736 aa  1481    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  100 
 
 
723 aa  1483    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  48.18 
 
 
728 aa  632  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  42.16 
 
 
700 aa  556  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  41.14 
 
 
718 aa  542  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  40.98 
 
 
714 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  42.58 
 
 
709 aa  535  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  42.11 
 
 
709 aa  536  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  40.11 
 
 
708 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  40.11 
 
 
708 aa  532  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  41.44 
 
 
714 aa  533  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  40.11 
 
 
708 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  43.9 
 
 
701 aa  519  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  41.67 
 
 
707 aa  521  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  39.72 
 
 
708 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  39.72 
 
 
708 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  40.95 
 
 
699 aa  490  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  41.09 
 
 
733 aa  485  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  41.72 
 
 
724 aa  472  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  38.79 
 
 
735 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  40.5 
 
 
722 aa  463  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  41.18 
 
 
715 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  40.69 
 
 
724 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  42.96 
 
 
747 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  39.03 
 
 
707 aa  431  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  37.79 
 
 
718 aa  432  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  36.04 
 
 
727 aa  428  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  40.85 
 
 
733 aa  414  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  39.61 
 
 
730 aa  415  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  37.81 
 
 
719 aa  411  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  41.21 
 
 
704 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  35.34 
 
 
740 aa  399  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  37.55 
 
 
747 aa  392  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  36.81 
 
 
726 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  36.16 
 
 
721 aa  385  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  36.15 
 
 
688 aa  379  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  40.41 
 
 
723 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  34.91 
 
 
729 aa  334  3e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  34.71 
 
 
734 aa  327  4.0000000000000003e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  36.47 
 
 
743 aa  323  6e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.58 
 
 
733 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  36.36 
 
 
768 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  32.62 
 
 
729 aa  321  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  36.51 
 
 
699 aa  320  5e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  30.7 
 
 
726 aa  320  7.999999999999999e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  31.83 
 
 
739 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  31.54 
 
 
734 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  31.37 
 
 
730 aa  312  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  30.86 
 
 
729 aa  311  2.9999999999999997e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  32.92 
 
 
818 aa  309  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  30.72 
 
 
713 aa  306  1.0000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  33.09 
 
 
774 aa  303  1e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  30.88 
 
 
722 aa  301  3e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  33.8 
 
 
750 aa  301  4e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  37.08 
 
 
701 aa  300  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  32.93 
 
 
726 aa  299  1e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  31.88 
 
 
740 aa  298  2e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  32.56 
 
 
729 aa  296  1e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  33.27 
 
 
729 aa  291  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  34.19 
 
 
716 aa  273  6e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  32.65 
 
 
713 aa  271  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  30.82 
 
 
730 aa  260  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  28.72 
 
 
727 aa  245  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  27.39 
 
 
726 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  30.97 
 
 
684 aa  154  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  32.13 
 
 
530 aa  134  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.72 
 
 
683 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  24.6 
 
 
657 aa  114  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  25.06 
 
 
706 aa  99.4  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  24.84 
 
 
675 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  26.6 
 
 
732 aa  87  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  23.25 
 
 
700 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  23.65 
 
 
723 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.36 
 
 
674 aa  82.4  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  26.11 
 
 
669 aa  82  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  25.12 
 
 
679 aa  74.7  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  28.11 
 
 
505 aa  71.6  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  25 
 
 
579 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  25.39 
 
 
579 aa  67  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  30.2 
 
 
484 aa  66.2  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.25 
 
 
510 aa  65.9  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  26.63 
 
 
578 aa  63.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  22.86 
 
 
579 aa  55.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  28.08 
 
 
589 aa  52.4  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  23.49 
 
 
562 aa  49.7  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  22.93 
 
 
429 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  24 
 
 
555 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  29.61 
 
 
1020 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  22.07 
 
 
824 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  26.86 
 
 
679 aa  44.7  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>