105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0237 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 
722 aa  1497    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  44.26 
 
 
729 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  44.91 
 
 
733 aa  589  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  44.2 
 
 
740 aa  584  1.0000000000000001e-165  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  42.22 
 
 
729 aa  568  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  42.8 
 
 
734 aa  561  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  45.83 
 
 
730 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  43.15 
 
 
729 aa  553  1e-156  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  41.74 
 
 
726 aa  543  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  41.59 
 
 
729 aa  541  9.999999999999999e-153  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  41.28 
 
 
739 aa  533  1e-150  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  41.02 
 
 
729 aa  523  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  41.79 
 
 
734 aa  491  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  37.57 
 
 
726 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  38.91 
 
 
743 aa  462  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  36.85 
 
 
818 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  34.63 
 
 
750 aa  441  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  36.21 
 
 
774 aa  439  9.999999999999999e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  38.87 
 
 
699 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  38.54 
 
 
713 aa  378  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  32.73 
 
 
701 aa  355  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  34.94 
 
 
716 aa  350  5e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  36.11 
 
 
730 aa  347  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 
727 aa  346  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  34.13 
 
 
718 aa  334  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  33.51 
 
 
728 aa  330  4e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  34.04 
 
 
733 aa  326  7e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  34.31 
 
 
730 aa  325  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  34.18 
 
 
701 aa  323  7e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  34.04 
 
 
707 aa  323  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  34.78 
 
 
714 aa  320  7.999999999999999e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  32.18 
 
 
726 aa  319  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  33.39 
 
 
714 aa  318  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  34.58 
 
 
699 aa  310  4e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  32.96 
 
 
747 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  32.21 
 
 
708 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  33.1 
 
 
709 aa  308  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  32.04 
 
 
708 aa  307  4.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  32.04 
 
 
708 aa  307  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  31.91 
 
 
709 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  30.88 
 
 
736 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  30.88 
 
 
723 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  32.31 
 
 
715 aa  300  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  35.03 
 
 
724 aa  300  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.87 
 
 
700 aa  299  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  32.86 
 
 
708 aa  299  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  32.86 
 
 
708 aa  299  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  34.05 
 
 
704 aa  297  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.54 
 
 
735 aa  293  5e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  33.21 
 
 
723 aa  293  5e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  33.46 
 
 
724 aa  293  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  35.59 
 
 
707 aa  291  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  31.93 
 
 
727 aa  288  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  33.41 
 
 
740 aa  286  7e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  31.7 
 
 
721 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  32.26 
 
 
733 aa  278  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  29.61 
 
 
718 aa  274  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.15 
 
 
719 aa  273  6e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  31.61 
 
 
722 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  30.21 
 
 
713 aa  272  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  32.95 
 
 
768 aa  266  1e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.09 
 
 
688 aa  260  6e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  29.71 
 
 
726 aa  260  6e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  30.83 
 
 
747 aa  246  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  25.29 
 
 
684 aa  160  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.64 
 
 
683 aa  155  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  24.74 
 
 
657 aa  142  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  24.56 
 
 
530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  24.31 
 
 
732 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  24.28 
 
 
669 aa  114  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.43 
 
 
674 aa  100  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  23.21 
 
 
723 aa  97.8  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  23.01 
 
 
675 aa  95.5  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  22.05 
 
 
679 aa  89.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  23.87 
 
 
706 aa  89.4  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  27.27 
 
 
700 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  29.76 
 
 
562 aa  72.4  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  23.83 
 
 
579 aa  67  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  21.5 
 
 
578 aa  60.8  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  23.12 
 
 
579 aa  59.7  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  29.81 
 
 
484 aa  58.5  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  24.06 
 
 
782 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.69 
 
 
510 aa  56.2  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  23 
 
 
679 aa  56.6  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  27.61 
 
 
752 aa  55.5  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  24.42 
 
 
429 aa  54.3  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  23.37 
 
 
552 aa  53.5  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  23.37 
 
 
552 aa  53.5  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  21.19 
 
 
505 aa  52.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5682  FenI protein  27.48 
 
 
520 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  31.52 
 
 
380 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1469  glycoside hydrolase family 31  28.21 
 
 
527 aa  48.9  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000732278  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  25.52 
 
 
589 aa  49.3  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1581  protein of unknown function DUF187  32.61 
 
 
406 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.088417 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  25.71 
 
 
555 aa  47.8  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  28.81 
 
 
1020 aa  47.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.85 
 
 
684 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0843  glycosy hydrolase family protein  26.92 
 
 
502 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00330381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0133  hypothetical protein  32.97 
 
 
395 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288293  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_002950  PG0061  yngK protein  28.26 
 
 
512 aa  44.7  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>