107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1483 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  100 
 
 
768 aa  1563    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  48.7 
 
 
704 aa  613  9.999999999999999e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  44.8 
 
 
727 aa  595  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  45.58 
 
 
724 aa  580  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  44.88 
 
 
726 aa  564  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  43.07 
 
 
707 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  42.65 
 
 
718 aa  555  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  45.43 
 
 
730 aa  554  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  45.1 
 
 
747 aa  554  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  43.06 
 
 
715 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  42.02 
 
 
721 aa  523  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  42.95 
 
 
747 aa  508  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  39.81 
 
 
740 aa  508  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  42.36 
 
 
733 aa  504  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  40.83 
 
 
724 aa  501  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  38.97 
 
 
735 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  40.13 
 
 
723 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  32.21 
 
 
708 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  32.21 
 
 
708 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  32.21 
 
 
708 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  37.04 
 
 
709 aa  389  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  37.12 
 
 
714 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  37.1 
 
 
709 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  37.18 
 
 
714 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  37.15 
 
 
718 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  35.55 
 
 
708 aa  372  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  35.55 
 
 
708 aa  372  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  37.14 
 
 
722 aa  362  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  36.2 
 
 
707 aa  361  3e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.66 
 
 
700 aa  358  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  39.64 
 
 
701 aa  337  7e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  36.97 
 
 
723 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  36.8 
 
 
736 aa  330  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  33.16 
 
 
733 aa  330  8e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.29 
 
 
688 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.77 
 
 
719 aa  327  4.0000000000000003e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  36.83 
 
 
728 aa  320  6e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  36.61 
 
 
699 aa  318  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  32.25 
 
 
739 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  34.38 
 
 
740 aa  268  2e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  33.21 
 
 
722 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  29.99 
 
 
743 aa  262  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  31.46 
 
 
729 aa  262  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  34.2 
 
 
733 aa  261  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  34.93 
 
 
818 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  30.39 
 
 
729 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  31.81 
 
 
729 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  31.29 
 
 
726 aa  252  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  33.27 
 
 
734 aa  251  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  30.91 
 
 
729 aa  246  9e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.9 
 
 
729 aa  246  9.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  32.99 
 
 
774 aa  243  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  28.79 
 
 
730 aa  243  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  39 
 
 
699 aa  243  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  35.18 
 
 
734 aa  242  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  40.2 
 
 
701 aa  241  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  36.67 
 
 
713 aa  234  5e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  35.55 
 
 
750 aa  229  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  31.63 
 
 
716 aa  217  5e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  30.87 
 
 
726 aa  216  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  36.73 
 
 
713 aa  212  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  32.45 
 
 
730 aa  203  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  29.48 
 
 
727 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  27.9 
 
 
726 aa  171  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  32.07 
 
 
530 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  26.9 
 
 
657 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.41 
 
 
683 aa  114  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  32.15 
 
 
684 aa  109  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.255741 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  30.68 
 
 
732 aa  97.4  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  27.92 
 
 
706 aa  87.8  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  25 
 
 
669 aa  84.7  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  29.3 
 
 
484 aa  73.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  23.91 
 
 
700 aa  72  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.72 
 
 
674 aa  71.6  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  29.91 
 
 
675 aa  71.2  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  24.69 
 
 
679 aa  68.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  25.55 
 
 
579 aa  66.6  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  24.88 
 
 
723 aa  64.7  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  24.67 
 
 
579 aa  63.9  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  25.31 
 
 
562 aa  61.2  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  28.81 
 
 
824 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  30.77 
 
 
1020 aa  59.7  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  25.88 
 
 
578 aa  58.9  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  26.9 
 
 
589 aa  57.4  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.93 
 
 
684 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1469  glycoside hydrolase family 31  22.68 
 
 
527 aa  53.5  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000732278  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  25.47 
 
 
505 aa  53.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  23.94 
 
 
552 aa  51.2  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  31.91 
 
 
548 aa  50.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  31.52 
 
 
558 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  21.56 
 
 
555 aa  49.7  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  34.44 
 
 
541 aa  50.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  19.8 
 
 
579 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  31.48 
 
 
568 aa  48.9  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  26.21 
 
 
679 aa  48.1  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  26.99 
 
 
441 aa  48.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  23.4 
 
 
552 aa  47.8  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  31.18 
 
 
471 aa  47.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.09 
 
 
510 aa  46.2  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0843  glycosy hydrolase family protein  25 
 
 
502 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00330381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>