98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1560 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  99.82 
 
 		 552 aa  1128    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  100 
 
 		 552 aa  1130    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  47.13 
 
 		 555 aa  528  1e-149  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  47.41 
 
 		 562 aa  481  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  38.6 
 
 		 679 aa  256  7e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  33.41 
 
 		 782 aa  233  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  35.37 
 
 		 510 aa  224  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  31.19 
 
 		 429 aa  213  7.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  37.85 
 
 		 484 aa  209  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  31.36 
 
 		 1020 aa  163  9e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  29.78 
 
 		 578 aa  163  9e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  29.25 
 
 		 579 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  31.9 
 
 		 579 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  27.81 
 
 		 505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  29.05 
 
 		 589 aa  136  8e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  28.91 
 
 		 824 aa  133  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  29.82 
 
 		 713 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.28 
 
 		 733 aa  67  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  28.86 
 
 		 733 aa  63.9  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  24.86 
 
 		 729 aa  64.3  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  34.88 
 
 		 679 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  28.31 
 
 		 708 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  28.31 
 
 		 708 aa  62  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  28.31 
 
 		 708 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  27.39 
 
 		 729 aa  61.6  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  24.49 
 
 		 716 aa  60.1  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  25.91 
 
 		 726 aa  59.3  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0259  glycoside hydrolase family 31  24.39 
 
 		 631 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0820064 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  28.26 
 
 		 818 aa  58.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.38 
 
 		 700 aa  56.2  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  26.35 
 
 		 694 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  28.48 
 
 		 530 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  26.92 
 
 		 743 aa  54.3  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3595  hypothetical protein  24.57 
 
 		 731 aa  53.9  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0030344  hitchhiker  0.000112547 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  26.95 
 
 		 728 aa  53.9  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  23.37 
 
 		 722 aa  53.5  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  23.88 
 
 		 739 aa  53.5  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1469  glycoside hydrolase family 31  28.77 
 
 		 527 aa  53.5  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000732278  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5646  hypothetical protein  23.67 
 
 		 666 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  28.7 
 
 		 774 aa  52.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  30.23 
 
 		 726 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  25.32 
 
 		 729 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4334  glycoside hydrolase family protein  27.81 
 
 		 616 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.53 
 
 		 718 aa  52  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  24.14 
 
 		 701 aa  51.6  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  23.94 
 
 		 730 aa  51.2  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  24.21 
 
 		 714 aa  51.2  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  26.47 
 
 		 723 aa  50.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  26.62 
 
 		 699 aa  50.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  22.94 
 
 		 734 aa  50.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  28.45 
 
 		 713 aa  50.8  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  23.29 
 
 		 714 aa  50.4  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  29.66 
 
 		 709 aa  50.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.41 
 
 		 707 aa  50.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.93 
 
 		 735 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.57 
 
 		 729 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  25.34 
 
 		 708 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  30.91 
 
 		 727 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  23.47 
 
 		 734 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  24.62 
 
 		 740 aa  48.5  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  23 
 
 		 730 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  25.34 
 
 		 708 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  25.85 
 
 		 772 aa  48.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0843  glycosy hydrolase family protein  27.04 
 
 		 502 aa  48.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00330381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  29.66 
 
 		 709 aa  48.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  24.16 
 
 		 723 aa  47.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  23.4 
 
 		 768 aa  48.1  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  23.77 
 
 		 700 aa  47.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  26.85 
 
 		 733 aa  47  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  23.65 
 
 		 718 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  25.37 
 
 		 701 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45442  predicted protein  25.34 
 
 		 430 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000628338  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  26.45 
 
 		 724 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  23.14 
 
 		 775 aa  45.8  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  23.32 
 
 		 772 aa  46.2  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  22.25 
 
 		 763 aa  46.2  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  23.77 
 
 		 772 aa  45.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  24.18 
 
 		 729 aa  45.8  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  23.85 
 
 		 740 aa  45.8  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  27.42 
 
 		 715 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.74376 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  23.32 
 
 		 772 aa  45.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  23.32 
 
 		 772 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  23.32 
 
 		 772 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.65 
 
 		 699 aa  45.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  23.32 
 
 		 772 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  23.32 
 
 		 772 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  22.53 
 
 		 747 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  23.32 
 
 		 772 aa  45.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1855  Carbohydrate binding family 6  25 
 
 		 892 aa  44.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  22.87 
 
 		 772 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  22.87 
 
 		 772 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  26.83 
 
 		 764 aa  43.9  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  22.87 
 
 		 772 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1712  glycoside hydrolase family 31  26.23 
 
 		 533 aa  43.9  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000051017  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  26.83 
 
 		 764 aa  43.9  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  23.32 
 
 		 772 aa  43.5  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  26.42 
 
 		 657 aa  43.5  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  22.87 
 
 		 772 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>