112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2439 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 
699 aa  1422    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  46.48 
 
 
713 aa  592  1e-168  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  46.3 
 
 
701 aa  558  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  38.67 
 
 
733 aa  523  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  39.94 
 
 
729 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  38.38 
 
 
729 aa  484  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  39.7 
 
 
734 aa  485  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  37.36 
 
 
734 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  37.24 
 
 
730 aa  479  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  36.36 
 
 
726 aa  467  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  34.05 
 
 
729 aa  419  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  38.87 
 
 
722 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  35.76 
 
 
726 aa  414  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  32.92 
 
 
729 aa  406  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  35.95 
 
 
730 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  40.03 
 
 
713 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  33.19 
 
 
739 aa  404  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  34.76 
 
 
750 aa  400  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  33.76 
 
 
726 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  32.28 
 
 
740 aa  391  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.81 
 
 
729 aa  385  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  36.5 
 
 
716 aa  367  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  35.55 
 
 
727 aa  366  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  34.47 
 
 
743 aa  352  1e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  34.08 
 
 
718 aa  348  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  32.76 
 
 
818 aa  343  9e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  31.69 
 
 
774 aa  332  1e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  36.51 
 
 
736 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  36.51 
 
 
723 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  35.56 
 
 
733 aa  322  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  37.55 
 
 
707 aa  320  6e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  38.05 
 
 
730 aa  317  4e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  35.83 
 
 
728 aa  316  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  34.8 
 
 
714 aa  316  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  34.27 
 
 
714 aa  313  7.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  36.1 
 
 
709 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  33.92 
 
 
708 aa  310  4e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  33.92 
 
 
708 aa  310  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  33.92 
 
 
708 aa  310  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  36.03 
 
 
709 aa  310  5e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  38.22 
 
 
708 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  38.22 
 
 
708 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  37.08 
 
 
718 aa  303  6.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  35.63 
 
 
701 aa  298  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  36.01 
 
 
747 aa  298  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  37.35 
 
 
733 aa  297  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  36.95 
 
 
721 aa  296  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.42 
 
 
700 aa  295  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  36.49 
 
 
699 aa  294  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  36.36 
 
 
724 aa  293  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  35.07 
 
 
722 aa  291  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  33.18 
 
 
688 aa  290  4e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  35.95 
 
 
715 aa  286  8e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  34.15 
 
 
724 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  36.46 
 
 
726 aa  284  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  36.89 
 
 
707 aa  283  9e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  35.62 
 
 
723 aa  282  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  37.52 
 
 
727 aa  282  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  37.84 
 
 
704 aa  278  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  34.25 
 
 
740 aa  275  3e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  33.5 
 
 
735 aa  274  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  36.97 
 
 
747 aa  271  4e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  33.27 
 
 
719 aa  258  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  38.7 
 
 
768 aa  254  5.000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  30.08 
 
 
530 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  28.94 
 
 
684 aa  176  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.18 
 
 
683 aa  166  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  28.38 
 
 
675 aa  164  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.5 
 
 
674 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  29.25 
 
 
657 aa  152  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  29.05 
 
 
679 aa  144  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  28.93 
 
 
669 aa  144  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  26.65 
 
 
706 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  23.92 
 
 
732 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  27.93 
 
 
723 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  29.56 
 
 
700 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  27.91 
 
 
578 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  25.99 
 
 
579 aa  72.4  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  24.56 
 
 
579 aa  71.2  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  24.69 
 
 
484 aa  69.7  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  27.12 
 
 
579 aa  68.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  33.33 
 
 
403 aa  54.7  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  31.19 
 
 
429 aa  54.7  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  31.71 
 
 
411 aa  54.3  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  24.53 
 
 
555 aa  53.9  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1469  glycoside hydrolase family 31  27.71 
 
 
527 aa  53.5  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000732278  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  32.58 
 
 
407 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  27.74 
 
 
589 aa  52.4  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  30.1 
 
 
562 aa  51.6  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  21.11 
 
 
505 aa  52  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  27.41 
 
 
824 aa  51.6  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  32.58 
 
 
471 aa  51.2  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.19 
 
 
684 aa  50.8  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  26.62 
 
 
552 aa  50.8  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  26.62 
 
 
552 aa  50.8  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0375  hypothetical protein  29.71 
 
 
700 aa  50.8  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  25.87 
 
 
694 aa  50.8  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  25.64 
 
 
1020 aa  48.9  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  30.48 
 
 
693 aa  48.5  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  30.21 
 
 
408 aa  48.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>