98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3567 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  86.94 
 
 
674 aa  1227    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 
675 aa  1399    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  32.86 
 
 
679 aa  323  4e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  29.88 
 
 
723 aa  241  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  30.13 
 
 
530 aa  209  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  25.92 
 
 
684 aa  160  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  28.26 
 
 
699 aa  159  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.93 
 
 
683 aa  150  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  28.43 
 
 
657 aa  139  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  26.36 
 
 
701 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  22.33 
 
 
713 aa  129  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  25.35 
 
 
734 aa  128  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  24.36 
 
 
714 aa  118  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  22.26 
 
 
708 aa  114  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  22.26 
 
 
708 aa  114  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  22.26 
 
 
708 aa  114  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  26.1 
 
 
709 aa  106  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  25 
 
 
713 aa  106  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  24.2 
 
 
729 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  21.86 
 
 
730 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  25.69 
 
 
704 aa  101  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  25.85 
 
 
708 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  25.85 
 
 
708 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.024409 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  25.65 
 
 
750 aa  99.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.39 
 
 
718 aa  99  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  23.95 
 
 
714 aa  96.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  29.45 
 
 
733 aa  96.3  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  25.47 
 
 
716 aa  96.3  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  25.18 
 
 
729 aa  95.1  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  23.01 
 
 
722 aa  95.5  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  26.54 
 
 
718 aa  94.7  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  25.06 
 
 
726 aa  95.1  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  22.25 
 
 
733 aa  94.7  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  25.05 
 
 
709 aa  93.6  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  24.84 
 
 
736 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  25.82 
 
 
726 aa  92.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  24.84 
 
 
723 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  25.47 
 
 
724 aa  92  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.84 
 
 
688 aa  91.3  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  26.9 
 
 
723 aa  90.9  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  26.52 
 
 
728 aa  90.9  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  30.2 
 
 
727 aa  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  22.84 
 
 
818 aa  90.1  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  25.94 
 
 
707 aa  89.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  28.79 
 
 
721 aa  87.8  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  23.68 
 
 
729 aa  86.7  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.25 
 
 
707 aa  87  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  22.36 
 
 
729 aa  86.3  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.24 
 
 
719 aa  85.9  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  25 
 
 
700 aa  85.5  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  21.01 
 
 
727 aa  84.3  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  24.6 
 
 
747 aa  84.3  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  31.76 
 
 
700 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  21.19 
 
 
739 aa  83.2  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  26.37 
 
 
715 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.72 
 
 
699 aa  82.4  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  20.75 
 
 
726 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  25.94 
 
 
669 aa  81.3  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.56 
 
 
735 aa  81.3  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  22.81 
 
 
729 aa  81.3  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  21.92 
 
 
743 aa  79  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  26.76 
 
 
722 aa  79  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  28.5 
 
 
726 aa  78.2  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  26.15 
 
 
701 aa  77  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  24.42 
 
 
730 aa  77  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  23.98 
 
 
724 aa  75.5  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  22.09 
 
 
740 aa  75.5  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.89 
 
 
684 aa  75.1  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  25.66 
 
 
774 aa  73.2  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  26.48 
 
 
733 aa  72.8  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  24.33 
 
 
740 aa  72  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  29.91 
 
 
768 aa  71.2  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  28.2 
 
 
747 aa  69.3  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  21.32 
 
 
730 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  23.42 
 
 
694 aa  67.4  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  21.41 
 
 
734 aa  64.7  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  29.68 
 
 
484 aa  62.4  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0811022 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  29.23 
 
 
732 aa  61.6  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  27.15 
 
 
505 aa  55.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  30 
 
 
579 aa  54.3  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  30.71 
 
 
578 aa  53.9  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  33.66 
 
 
411 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  23.28 
 
 
706 aa  53.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4312  hypothetical protein  20.42 
 
 
1413 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319357  normal  0.568612 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  26.7 
 
 
429 aa  52.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  42.59 
 
 
693 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  23.38 
 
 
562 aa  48.9  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4311  hypothetical protein  23.26 
 
 
1405 aa  49.3  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.861205  normal  0.589522 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  27.5 
 
 
579 aa  48.5  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  30.69 
 
 
403 aa  48.5  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  33.65 
 
 
407 aa  48.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  26.4 
 
 
442 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6343  hypothetical protein  22.13 
 
 
728 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473344  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  30.53 
 
 
567 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  30.25 
 
 
450 aa  45.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  22.97 
 
 
387 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  29.13 
 
 
471 aa  45.4  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  26.23 
 
 
782 aa  44.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>