63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6587 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  100 
 
 		 579 aa  1175    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  23.71 
 
 		 727 aa  72  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  27.12 
 
 		 699 aa  68.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  23.08 
 
 		 747 aa  64.7  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  23.67 
 
 		 721 aa  64.7  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  27.36 
 
 		 728 aa  63.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  26.24 
 
 		 739 aa  62.8  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  23.53 
 
 		 707 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45442  predicted protein  27.65 
 
 		 430 aa  62  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000628338  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.98 
 
 		 718 aa  60.5  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  24.04 
 
 		 701 aa  59.7  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  22.73 
 
 		 733 aa  58.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  25.81 
 
 		 706 aa  57.4  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  30.3 
 
 		 484 aa  56.6  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  22.12 
 
 		 724 aa  57  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  27.98 
 
 		 505 aa  56.6  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  23.05 
 
 		 730 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  24.18 
 
 		 704 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  23.47 
 
 		 708 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  23.47 
 
 		 708 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  23.47 
 
 		 708 aa  55.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  22.86 
 
 		 736 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  22.86 
 
 		 723 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  23.51 
 
 		 722 aa  55.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  26.67 
 
 		 750 aa  54.3  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  20.98 
 
 		 818 aa  53.5  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  25 
 
 		 733 aa  53.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  26.59 
 
 		 701 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  23.71 
 
 		 774 aa  52.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  24.12 
 
 		 709 aa  52.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  28.03 
 
 		 713 aa  52.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  23.08 
 
 		 530 aa  50.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  23.59 
 
 		 734 aa  50.8  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  25 
 
 		 714 aa  50.8  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  22.81 
 
 		 715 aa  50.8  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  22.52 
 
 		 713 aa  50.8  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  23.72 
 
 		 726 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  24.63 
 
 		 714 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.28 
 
 		 700 aa  49.7  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  19.8 
 
 		 768 aa  49.7  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1770  glycoside hydrolase family 31  25 
 
 		 515 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.134766  normal  0.116734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  24.32 
 
 		 694 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.04 
 
 		 733 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  22.45 
 
 		 729 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  22.16 
 
 		 726 aa  49.7  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  22.15 
 
 		 730 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  19.83 
 
 		 743 aa  48.9  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  22.02 
 
 		 707 aa  48.5  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  26.02 
 
 		 684 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  26.88 
 
 		 578 aa  48.5  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  26.29 
 
 		 555 aa  47.8  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  24.53 
 
 		 726 aa  47.4  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.42 
 
 		 684 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  22.33 
 
 		 719 aa  47  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.29 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.2 
 
 		 699 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  26.98 
 
 		 679 aa  46.2  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1712  glycoside hydrolase family 31  26.28 
 
 		 533 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000051017  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  20 
 
 		 709 aa  45.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0843  glycosy hydrolase family protein  22.56 
 
 		 502 aa  44.7  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00330381  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.43 
 
 		 688 aa  44.3  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  26.29 
 
 		 657 aa  43.5  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  22.53 
 
 		 727 aa  43.5  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>