102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0633 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  53.76 
 
 		 700 aa  810    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  68.75 
 
 		 707 aa  1023    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  60.08 
 
 		 708 aa  920    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  67.23 
 
 		 708 aa  1014    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  60.08 
 
 		 708 aa  920    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  60.08 
 
 		 708 aa  920    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  67.23 
 
 		 708 aa  1014    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  71.33 
 
 		 709 aa  1047    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  71.89 
 
 		 709 aa  1054    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 		 714 aa  1467    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  94.54 
 
 		 714 aa  1396    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  46.07 
 
 		 722 aa  609  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  41.67 
 
 		 718 aa  545  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  41.44 
 
 		 723 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  41.44 
 
 		 736 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  40.69 
 
 		 724 aa  532  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  40.08 
 
 		 735 aa  532  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  40.38 
 
 		 727 aa  521  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  43.52 
 
 		 715 aa  511  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  42.9 
 
 		 728 aa  504  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  41.82 
 
 		 747 aa  500  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  40.36 
 
 		 721 aa  500  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  41.77 
 
 		 733 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  41.95 
 
 		 724 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  40.17 
 
 		 726 aa  486  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  39.31 
 
 		 718 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  40.11 
 
 		 730 aa  487  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  41.61 
 
 		 704 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  42.47 
 
 		 701 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  38.86 
 
 		 707 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  40.23 
 
 		 723 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  39.23 
 
 		 740 aa  458  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  39.52 
 
 		 733 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  38.12 
 
 		 719 aa  445  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  37.61 
 
 		 699 aa  418  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  37.4 
 
 		 747 aa  411  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  37.96 
 
 		 688 aa  404  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  37.12 
 
 		 768 aa  379  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  35.17 
 
 		 729 aa  353  5e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.5 
 
 		 733 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  34.18 
 
 		 729 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  32.69 
 
 		 734 aa  334  3e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  32.58 
 
 		 730 aa  332  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  31.59 
 
 		 739 aa  330  4e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  32.15 
 
 		 726 aa  320  5e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  31.59 
 
 		 713 aa  319  1e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  31.73 
 
 		 734 aa  319  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  33.39 
 
 		 722 aa  318  2e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  32.68 
 
 		 729 aa  313  9e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  33.59 
 
 		 818 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  34.27 
 
 		 699 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  32.31 
 
 		 750 aa  303  6.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  30.85 
 
 		 774 aa  298  3e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  33.22 
 
 		 726 aa  297  4e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  34.62 
 
 		 701 aa  287  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  32.69 
 
 		 713 aa  282  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  33.27 
 
 		 716 aa  282  2e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  34.09 
 
 		 729 aa  279  2e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  32.3 
 
 		 740 aa  275  3e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  29.67 
 
 		 743 aa  265  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.38 
 
 		 729 aa  264  4.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  28.52 
 
 		 730 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  25.58 
 
 		 726 aa  231  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  29.82 
 
 		 727 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  27.12 
 
 		 684 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  28.5 
 
 		 530 aa  128  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.92 
 
 		 683 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  29.46 
 
 		 657 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  28.43 
 
 		 706 aa  109  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.42 
 
 		 674 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  23.95 
 
 		 675 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  24.15 
 
 		 723 aa  95.1  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  27.07 
 
 		 669 aa  82.8  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  24.32 
 
 		 679 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  25.11 
 
 		 732 aa  80.1  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  24.26 
 
 		 700 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  25.1 
 
 		 579 aa  64.7  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  27.51 
 
 		 562 aa  64.3  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  27.11 
 
 		 578 aa  63.9  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  23.29 
 
 		 579 aa  63.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  29.27 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  29.7 
 
 		 1020 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  33.03 
 
 		 589 aa  52.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1469  glycoside hydrolase family 31  25 
 
 		 527 aa  52  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000732278  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  25.16 
 
 		 505 aa  52  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  34.18 
 
 		 782 aa  51.2  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  23.29 
 
 		 552 aa  50.8  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0843  glycosy hydrolase family protein  24.4 
 
 		 502 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00330381  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  23.29 
 
 		 552 aa  50.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  26.09 
 
 		 694 aa  50.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  24.63 
 
 		 579 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  26.28 
 
 		 679 aa  49.3  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.46 
 
 		 684 aa  48.9  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  31.03 
 
 		 411 aa  48.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  33.33 
 
 		 541 aa  47  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  32.58 
 
 		 408 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  24.64 
 
 		 824 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  29.21 
 
 		 403 aa  45.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  30.34 
 
 		 407 aa  45.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0375  hypothetical protein  29.59 
 
 		 700 aa  45.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>