95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1356 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  52.27 
 
 		 657 aa  639    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  100 
 
 		 683 aa  1387    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  76.98 
 
 		 684 aa  1096    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  41.01 
 
 		 669 aa  418  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  32.77 
 
 		 530 aa  218  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.47 
 
 		 733 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  25.33 
 
 		 713 aa  171  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  29.97 
 
 		 701 aa  164  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  28.03 
 
 		 729 aa  164  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  33 
 
 		 699 aa  163  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  25.29 
 
 		 726 aa  160  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  34.1 
 
 		 701 aa  158  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  26.64 
 
 		 722 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.86 
 
 		 674 aa  154  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  25.62 
 
 		 729 aa  152  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  25.36 
 
 		 729 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  27.93 
 
 		 675 aa  150  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  26.35 
 
 		 743 aa  149  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  24.37 
 
 		 739 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.33 
 
 		 729 aa  148  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  25.48 
 
 		 740 aa  142  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  24.05 
 
 		 730 aa  140  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  29.04 
 
 		 734 aa  140  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  24.71 
 
 		 734 aa  140  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  26.67 
 
 		 716 aa  140  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  31.35 
 
 		 727 aa  135  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  26.41 
 
 		 724 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  27.72 
 
 		 733 aa  132  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  30.06 
 
 		 715 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  26.32 
 
 		 736 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  23.83 
 
 		 730 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  29.72 
 
 		 723 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  23.66 
 
 		 729 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  29.9 
 
 		 679 aa  127  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  27.14 
 
 		 706 aa  125  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  31.61 
 
 		 724 aa  125  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  25.33 
 
 		 723 aa  124  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.77 
 
 		 699 aa  123  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.03 
 
 		 718 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  22.74 
 
 		 727 aa  122  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  25.16 
 
 		 750 aa  122  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  25.78 
 
 		 726 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  30.41 
 
 		 728 aa  121  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  28.29 
 
 		 713 aa  121  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  28.11 
 
 		 708 aa  120  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  28.11 
 
 		 708 aa  120  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  27.44 
 
 		 740 aa  120  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  28.11 
 
 		 708 aa  120  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  26.59 
 
 		 714 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  30.8 
 
 		 723 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  26.92 
 
 		 714 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  31.74 
 
 		 704 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  25.47 
 
 		 818 aa  117  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.41 
 
 		 707 aa  118  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  27.75 
 
 		 733 aa  117  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.5 
 
 		 735 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  30.75 
 
 		 721 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.96 
 
 		 700 aa  116  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  26.45 
 
 		 708 aa  115  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  26.45 
 
 		 708 aa  115  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.024409 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  24.56 
 
 		 732 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  33.08 
 
 		 768 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  28.09 
 
 		 707 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  29.77 
 
 		 709 aa  112  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.23 
 
 		 688 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  28.87 
 
 		 709 aa  111  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  33.42 
 
 		 730 aa  110  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.81 
 
 		 719 aa  108  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  31.15 
 
 		 718 aa  108  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  27.55 
 
 		 774 aa  107  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  24.94 
 
 		 726 aa  103  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  30.37 
 
 		 747 aa  103  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  24.37 
 
 		 722 aa  100  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  30.12 
 
 		 726 aa  96.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  29.6 
 
 		 747 aa  82.8  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  25.1 
 
 		 824 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  19.87 
 
 		 700 aa  58.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  28.33 
 
 		 1020 aa  57.8  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  30 
 
 		 445 aa  55.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  25.9 
 
 		 727 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  25.71 
 
 		 484 aa  52  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  27.01 
 
 		 407 aa  51.6  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  26.86 
 
 		 604 aa  50.8  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.43 
 
 		 684 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  24.75 
 
 		 578 aa  49.7  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  25.4 
 
 		 441 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  34.34 
 
 		 408 aa  48.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  27.04 
 
 		 387 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  29.82 
 
 		 408 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  28.81 
 
 		 589 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  27.22 
 
 		 679 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  30.61 
 
 		 411 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  34.78 
 
 		 597 aa  44.3  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  25 
 
 		 453 aa  44.7  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  24.72 
 
 		 446 aa  44.3  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>