96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4910 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 		 715 aa  1402    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  55.31 
 
 		 724 aa  664    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  51.86 
 
 		 721 aa  644    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  53.56 
 
 		 727 aa  678    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  53.87 
 
 		 704 aa  652    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  52.25 
 
 		 707 aa  637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  53.21 
 
 		 726 aa  640    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  54.19 
 
 		 733 aa  657    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  52.11 
 
 		 730 aa  632  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  49 
 
 		 735 aa  632  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  49.09 
 
 		 718 aa  627  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  49.38 
 
 		 724 aa  621  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  49.93 
 
 		 747 aa  620  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  50.07 
 
 		 723 aa  605  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  51.09 
 
 		 747 aa  597  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  46.95 
 
 		 740 aa  594  1e-168  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  42.52 
 
 		 768 aa  534  1e-150  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  44.63 
 
 		 709 aa  530  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  45.17 
 
 		 709 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  41.79 
 
 		 714 aa  514  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  39.08 
 
 		 708 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  39.08 
 
 		 708 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  39.08 
 
 		 708 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  41.9 
 
 		 714 aa  505  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  39.89 
 
 		 718 aa  501  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  40.99 
 
 		 708 aa  498  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  40.99 
 
 		 708 aa  498  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  40.47 
 
 		 700 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  40.06 
 
 		 707 aa  490  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  39.55 
 
 		 722 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  40.11 
 
 		 736 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  40.11 
 
 		 723 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  38.87 
 
 		 701 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  39.72 
 
 		 728 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  39.36 
 
 		 733 aa  402  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  37.82 
 
 		 719 aa  395  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  38.52 
 
 		 688 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  39.97 
 
 		 699 aa  356  7.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  33.52 
 
 		 739 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 		 729 aa  302  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  32.31 
 
 		 722 aa  301  4e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  33.82 
 
 		 740 aa  301  4e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  35.23 
 
 		 729 aa  300  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  28.35 
 
 		 734 aa  297  5e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  27.71 
 
 		 730 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.9 
 
 		 733 aa  293  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  29.01 
 
 		 726 aa  291  4e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  31.07 
 
 		 734 aa  290  7e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  33.66 
 
 		 729 aa  290  8e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  28.84 
 
 		 729 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  40.23 
 
 		 701 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  33.58 
 
 		 774 aa  284  4.0000000000000003e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  35.95 
 
 		 699 aa  282  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.37 
 
 		 729 aa  275  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  28.55 
 
 		 713 aa  267  5.999999999999999e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  30.66 
 
 		 743 aa  267  5.999999999999999e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  37.38 
 
 		 713 aa  266  7e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  30.91 
 
 		 818 aa  266  7e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  31.68 
 
 		 750 aa  265  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.261984 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  31.2 
 
 		 726 aa  264  3e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  35.09 
 
 		 716 aa  228  4e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  26.78 
 
 		 730 aa  217  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  29.8 
 
 		 727 aa  203  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  25.74 
 
 		 726 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  33.41 
 
 		 684 aa  141  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  38.12 
 
 		 530 aa  139  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.06 
 
 		 683 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  28.32 
 
 		 657 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  27.86 
 
 		 706 aa  100  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  28.52 
 
 		 732 aa  94.4  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  28.87 
 
 		 669 aa  92.8  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  25.89 
 
 		 723 aa  87  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  26.37 
 
 		 675 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  28.67 
 
 		 679 aa  82.4  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.75 
 
 		 674 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  22.84 
 
 		 700 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  33.91 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.94 
 
 		 510 aa  58.2  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  25.79 
 
 		 579 aa  57.4  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  28.18 
 
 		 579 aa  55.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  32.76 
 
 		 1020 aa  54.3  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  26.52 
 
 		 589 aa  53.5  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  26.95 
 
 		 558 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  24.42 
 
 		 578 aa  52.4  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  26.63 
 
 		 562 aa  52.4  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  22.81 
 
 		 579 aa  51.2  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  25 
 
 		 505 aa  48.9  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.77 
 
 		 684 aa  48.5  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0375  hypothetical protein  28.99 
 
 		 700 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1469  glycoside hydrolase family 31  26.32 
 
 		 527 aa  46.6  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000732278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  27.42 
 
 		 552 aa  45.8  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  33.33 
 
 		 782 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  27.42 
 
 		 552 aa  45.8  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  28.7 
 
 		 429 aa  45.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  32.98 
 
 		 411 aa  44.3  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  24.36 
 
 		 824 aa  44.3  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.321699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>