92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0304 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 
429 aa  863    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  36.88 
 
 
679 aa  232  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  34.01 
 
 
562 aa  214  2.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  31.19 
 
 
552 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  31.19 
 
 
552 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  28.91 
 
 
555 aa  197  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.26 
 
 
510 aa  189  7e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  40.5 
 
 
782 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  31.34 
 
 
484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  33.33 
 
 
505 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  37.84 
 
 
578 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  33.65 
 
 
579 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  31.65 
 
 
579 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  24.84 
 
 
589 aa  114  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  30.3 
 
 
1020 aa  113  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  28.48 
 
 
824 aa  97.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1469  glycoside hydrolase family 31  23.19 
 
 
527 aa  59.3  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000732278  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  29.51 
 
 
733 aa  56.6  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.82 
 
 
733 aa  56.6  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  27.83 
 
 
729 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  30.36 
 
 
679 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  24.28 
 
 
740 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  25.81 
 
 
729 aa  54.3  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  31.19 
 
 
699 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  24.42 
 
 
722 aa  54.3  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0843  glycosy hydrolase family protein  25.87 
 
 
502 aa  53.9  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00330381  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  23.79 
 
 
700 aa  53.5  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.86 
 
 
729 aa  53.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.18 
 
 
674 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  26.7 
 
 
675 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.4 
 
 
707 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  33.65 
 
 
713 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  34.25 
 
 
708 aa  51.2  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  34.25 
 
 
708 aa  51.2  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  28.57 
 
 
734 aa  51.2  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  34.25 
 
 
708 aa  51.2  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  27.01 
 
 
728 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  27.12 
 
 
707 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  28.57 
 
 
730 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  23.39 
 
 
716 aa  50.4  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  31.07 
 
 
694 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  27.59 
 
 
739 aa  50.1  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.39 
 
 
688 aa  50.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  36 
 
 
709 aa  50.1  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  28.46 
 
 
701 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  30.08 
 
 
708 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  24.49 
 
 
818 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4334  glycoside hydrolase family protein  25.81 
 
 
616 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  30.08 
 
 
708 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  26.75 
 
 
747 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  27.68 
 
 
730 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0259  glycoside hydrolase family 31  24.5 
 
 
631 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0820064 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  27.27 
 
 
750 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45442  predicted protein  32.1 
 
 
430 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000628338  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  23.08 
 
 
712 aa  47.4  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  35.62 
 
 
700 aa  47  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  27.1 
 
 
726 aa  47  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  26.67 
 
 
734 aa  46.6  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  26.13 
 
 
727 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  26.89 
 
 
718 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  22.93 
 
 
723 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.53 
 
 
699 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  27.47 
 
 
726 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  22.93 
 
 
736 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  25.79 
 
 
530 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  33.78 
 
 
714 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  25.4 
 
 
721 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  29.55 
 
 
713 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  24.48 
 
 
772 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  24.48 
 
 
772 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  22.86 
 
 
729 aa  45.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  26.36 
 
 
730 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  26.06 
 
 
772 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  24.48 
 
 
772 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  28.7 
 
 
715 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  30.52 
 
 
727 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  30.58 
 
 
714 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  30.26 
 
 
729 aa  45.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  23.61 
 
 
775 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  24.48 
 
 
772 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.68 
 
 
684 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  28.7 
 
 
724 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.72 
 
 
718 aa  44.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  25 
 
 
740 aa  44.3  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  24.48 
 
 
772 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  28.85 
 
 
724 aa  43.9  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 
709 aa  43.9  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  25.35 
 
 
764 aa  43.9  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  25.35 
 
 
764 aa  43.9  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38421  predicted protein  23.68 
 
 
559 aa  43.1  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452022  hitchhiker  0.000596343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.63 
 
 
735 aa  43.1  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  25.9 
 
 
726 aa  43.1  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>