91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1907 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  55.79 
 
 		 727 aa  806    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 		 730 aa  1517    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  50.07 
 
 		 726 aa  746    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  40.19 
 
 		 716 aa  531  1e-149  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  35.95 
 
 		 699 aa  397  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  35.17 
 
 		 729 aa  395  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  36.01 
 
 		 729 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  34.29 
 
 		 713 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  34.08 
 
 		 726 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  34.37 
 
 		 733 aa  382  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  32.37 
 
 		 734 aa  357  3.9999999999999996e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  34.2 
 
 		 734 aa  355  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  34.18 
 
 		 739 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  33.89 
 
 		 730 aa  352  2e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  32.11 
 
 		 729 aa  351  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  36.11 
 
 		 722 aa  347  3e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  34.22 
 
 		 729 aa  343  7e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  32.33 
 
 		 750 aa  336  1e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  32.46 
 
 		 740 aa  335  1e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  31 
 
 		 701 aa  331  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  31.1 
 
 		 726 aa  324  4e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  35.7 
 
 		 818 aa  317  5e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  32.01 
 
 		 729 aa  317  5e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  35.37 
 
 		 743 aa  317  6e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  33.17 
 
 		 733 aa  290  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  33.07 
 
 		 774 aa  275  2.0000000000000002e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  29.8 
 
 		 728 aa  274  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.57 
 
 		 718 aa  261  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  30.82 
 
 		 736 aa  260  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  30.82 
 
 		 723 aa  260  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  29.26 
 
 		 714 aa  258  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  29.9 
 
 		 709 aa  256  9e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.04 
 
 		 699 aa  252  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  26.92 
 
 		 713 aa  249  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  28.32 
 
 		 709 aa  249  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  28.52 
 
 		 714 aa  244  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.42 
 
 		 719 aa  244  6e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  28.12 
 
 		 708 aa  243  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  28.12 
 
 		 708 aa  243  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  28.12 
 
 		 708 aa  243  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.95 
 
 		 707 aa  241  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  29.72 
 
 		 730 aa  239  9e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  32.68 
 
 		 701 aa  233  9e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  32.31 
 
 		 708 aa  232  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  32.31 
 
 		 708 aa  232  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.65 
 
 		 700 aa  231  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.2 
 
 		 688 aa  231  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  26.26 
 
 		 727 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  28.78 
 
 		 722 aa  226  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  29.82 
 
 		 724 aa  223  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  30.65 
 
 		 740 aa  221  6e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  28.25 
 
 		 704 aa  219  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  28.93 
 
 		 747 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  29.2 
 
 		 724 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  29.19 
 
 		 718 aa  216  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  29.66 
 
 		 723 aa  214  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  28.01 
 
 		 715 aa  213  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.28 
 
 		 735 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  27.07 
 
 		 707 aa  205  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  32.45 
 
 		 768 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  27.52 
 
 		 721 aa  196  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  30 
 
 		 733 aa  191  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  29.3 
 
 		 747 aa  181  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  28.02 
 
 		 726 aa  177  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  24.18 
 
 		 684 aa  135  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.83 
 
 		 683 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  26.55 
 
 		 530 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  23.87 
 
 		 657 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  21.86 
 
 		 675 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  20.7 
 
 		 706 aa  97.4  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  23.87 
 
 		 669 aa  97.4  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  23.12 
 
 		 732 aa  97.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.71 
 
 		 674 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  22.22 
 
 		 723 aa  79  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  29.86 
 
 		 484 aa  70.9  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  27.22 
 
 		 700 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  20.92 
 
 		 679 aa  68.2  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  28.66 
 
 		 579 aa  60.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  27.16 
 
 		 579 aa  58.9  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  25 
 
 		 562 aa  56.2  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  28.38 
 
 		 578 aa  54.3  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  24.81 
 
 		 782 aa  54.3  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  28.18 
 
 		 1020 aa  51.2  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.47 
 
 		 510 aa  50.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  23 
 
 		 552 aa  48.9  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  23 
 
 		 552 aa  48.5  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  22.15 
 
 		 579 aa  48.5  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  27.68 
 
 		 429 aa  48.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4566  hypothetical protein  29.84 
 
 		 335 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  22.17 
 
 		 505 aa  47  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  30.21 
 
 		 694 aa  44.3  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>