94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1360 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  100 
 
 		 674 aa  1396    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  86.94 
 
 		 675 aa  1227    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  31.89 
 
 		 679 aa  324  4e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  28.57 
 
 		 723 aa  237  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  29.74 
 
 		 530 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  26.46 
 
 		 684 aa  164  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  29.35 
 
 		 699 aa  154  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.86 
 
 		 683 aa  154  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  27.76 
 
 		 657 aa  137  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  26.42 
 
 		 701 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  26.12 
 
 		 734 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  21.81 
 
 		 713 aa  129  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  25.71 
 
 		 714 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  25.31 
 
 		 713 aa  114  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  27.46 
 
 		 750 aa  112  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  23.54 
 
 		 708 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  23.54 
 
 		 708 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  23.54 
 
 		 708 aa  109  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  25.62 
 
 		 708 aa  103  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  25.62 
 
 		 708 aa  103  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  24.42 
 
 		 714 aa  103  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  24.84 
 
 		 729 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  23.43 
 
 		 722 aa  100  8e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.05 
 
 		 733 aa  100  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.85 
 
 		 718 aa  100  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  25.74 
 
 		 709 aa  99  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  26.54 
 
 		 718 aa  97.1  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  23.71 
 
 		 818 aa  97.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  30.1 
 
 		 733 aa  96.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  25.45 
 
 		 747 aa  95.5  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  26.26 
 
 		 704 aa  93.2  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  25.42 
 
 		 726 aa  93.6  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  25.47 
 
 		 716 aa  93.2  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  26.54 
 
 		 707 aa  92  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  27.56 
 
 		 728 aa  91.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  25.75 
 
 		 726 aa  91.3  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  27.1 
 
 		 723 aa  91.3  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.21 
 
 		 729 aa  90.9  7e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.58 
 
 		 688 aa  90.9  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  23.71 
 
 		 730 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  30.05 
 
 		 727 aa  89  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  23.63 
 
 		 739 aa  88.2  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  24.23 
 
 		 729 aa  87.8  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  25.11 
 
 		 709 aa  87.8  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  30.97 
 
 		 721 aa  87  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  23.88 
 
 		 729 aa  87  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  24.39 
 
 		 724 aa  87  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.53 
 
 		 707 aa  85.5  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.37 
 
 		 700 aa  84  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  31.18 
 
 		 700 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  23.73 
 
 		 729 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.27 
 
 		 699 aa  83.2  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.9 
 
 		 719 aa  83.2  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  25.36 
 
 		 723 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  25.36 
 
 		 736 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  22.92 
 
 		 701 aa  81.3  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  25.23 
 
 		 730 aa  80.5  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  24.75 
 
 		 715 aa  80.1  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.34 
 
 		 684 aa  79  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  25.59 
 
 		 669 aa  78.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  25.09 
 
 		 726 aa  77.8  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  25.32 
 
 		 724 aa  77.8  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  20.89 
 
 		 727 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  24.3 
 
 		 743 aa  75.9  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  22.38 
 
 		 740 aa  75.9  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.05 
 
 		 735 aa  76.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  26.11 
 
 		 774 aa  76.3  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  25.93 
 
 		 733 aa  75.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  26.06 
 
 		 722 aa  75.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  20.33 
 
 		 726 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  24.77 
 
 		 694 aa  72.8  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  29.72 
 
 		 768 aa  72  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  23.83 
 
 		 740 aa  71.6  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  20.73 
 
 		 730 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  21.62 
 
 		 732 aa  65.5  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  27 
 
 		 747 aa  64.7  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  20.98 
 
 		 734 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  28.93 
 
 		 484 aa  62.4  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  29.2 
 
 		 578 aa  55.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  25.83 
 
 		 505 aa  55.1  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  31.68 
 
 		 411 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  28.18 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  28.33 
 
 		 579 aa  52.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4312  hypothetical protein  20.43 
 
 		 1413 aa  51.2  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319357  normal  0.568612 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  23.28 
 
 		 706 aa  50.4  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  32.22 
 
 		 693 aa  48.5  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  25.83 
 
 		 579 aa  47  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  23.38 
 
 		 562 aa  47.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0138  alpha amylase, catalytic region  34.52 
 
 		 732 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  30 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  30.56 
 
 		 442 aa  45.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  27.68 
 
 		 782 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  30.25 
 
 		 450 aa  44.3  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  26.85 
 
 		 407 aa  44.3  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>