93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2118 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  50.91 
 
 		 718 aa  679    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  57.66 
 
 		 727 aa  768    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  56.68 
 
 		 726 aa  733    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  55.59 
 
 		 704 aa  701    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  55.38 
 
 		 707 aa  700    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  51.65 
 
 		 747 aa  647    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  52.82 
 
 		 733 aa  669    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 		 721 aa  1426    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  49.09 
 
 		 740 aa  638    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  56.33 
 
 		 747 aa  734    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  57.04 
 
 		 730 aa  702    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  51.86 
 
 		 715 aa  657    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  56.19 
 
 		 724 aa  714    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  47.67 
 
 		 724 aa  624  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  46.39 
 
 		 735 aa  611  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  43.71 
 
 		 709 aa  544  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  42.71 
 
 		 709 aa  545  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  46.75 
 
 		 723 aa  536  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  42 
 
 		 768 aa  526  1e-148  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  41.43 
 
 		 714 aa  522  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  41.03 
 
 		 708 aa  513  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  40.36 
 
 		 714 aa  515  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  41.03 
 
 		 708 aa  513  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  39.78 
 
 		 718 aa  509  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  39.83 
 
 		 707 aa  505  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  38.29 
 
 		 708 aa  501  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  38.29 
 
 		 708 aa  501  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  38.29 
 
 		 708 aa  501  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  38.66 
 
 		 700 aa  497  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  42.04 
 
 		 722 aa  482  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  38.31 
 
 		 728 aa  412  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  36.16 
 
 		 723 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  36.16 
 
 		 736 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  37.62 
 
 		 699 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  41.4 
 
 		 701 aa  389  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  38.45 
 
 		 733 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  35.58 
 
 		 719 aa  371  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  36.06 
 
 		 688 aa  358  2.9999999999999997e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 		 739 aa  319  1e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  31.07 
 
 		 729 aa  303  7.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  36.95 
 
 		 699 aa  290  8e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  29.61 
 
 		 729 aa  287  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  31.7 
 
 		 722 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  29.18 
 
 		 774 aa  285  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  33.95 
 
 		 734 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  31.27 
 
 		 740 aa  280  9e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  29.52 
 
 		 729 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  30.59 
 
 		 729 aa  276  1.0000000000000001e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.67 
 
 		 733 aa  272  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  29.73 
 
 		 818 aa  269  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  28.66 
 
 		 743 aa  269  1e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.45 
 
 		 729 aa  268  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  29.15 
 
 		 734 aa  266  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  28.85 
 
 		 730 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  31.84 
 
 		 726 aa  265  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  32.5 
 
 		 701 aa  261  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  34.38 
 
 		 726 aa  259  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  34.9 
 
 		 750 aa  258  4e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  30.51 
 
 		 713 aa  250  8e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  34.55 
 
 		 713 aa  246  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  31.59 
 
 		 716 aa  204  5e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  27.52 
 
 		 730 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  28.18 
 
 		 727 aa  191  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  28.35 
 
 		 726 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  33.42 
 
 		 530 aa  144  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  29.4 
 
 		 657 aa  135  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  31.4 
 
 		 684 aa  128  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.75 
 
 		 683 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  31.14 
 
 		 669 aa  105  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  29.93 
 
 		 706 aa  101  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  26.96 
 
 		 679 aa  95.1  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  27.02 
 
 		 732 aa  92.4  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  26.12 
 
 		 723 aa  90.1  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  29.06 
 
 		 675 aa  89  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  25.26 
 
 		 700 aa  87.8  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.04 
 
 		 674 aa  87.8  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  23.37 
 
 		 579 aa  64.7  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  24.72 
 
 		 579 aa  59.3  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  32.14 
 
 		 484 aa  55.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  26.04 
 
 		 562 aa  55.5  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.52 
 
 		 510 aa  54.3  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  26.06 
 
 		 589 aa  53.9  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  23.31 
 
 		 579 aa  53.5  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  24.73 
 
 		 578 aa  52.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  25.9 
 
 		 1020 aa  52  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  22.22 
 
 		 505 aa  51.2  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  27.27 
 
 		 694 aa  47.8  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  22.75 
 
 		 684 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  25.4 
 
 		 429 aa  45.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0133  hypothetical protein  28.09 
 
 		 395 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288293  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  27.36 
 
 		 548 aa  45.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  31.03 
 
 		 411 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0375  hypothetical protein  31.96 
 
 		 700 aa  45.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>