91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1094 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  53.09 
 
 
715 aa  661    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  66.11 
 
 
724 aa  883    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 
730 aa  1432    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  57.04 
 
 
721 aa  723    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  55.39 
 
 
727 aa  736    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  55.43 
 
 
704 aa  683    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  53.1 
 
 
718 aa  702    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  58.28 
 
 
747 aa  737    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  50 
 
 
740 aa  656    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  55.59 
 
 
747 aa  665    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  64.57 
 
 
707 aa  847    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  55.52 
 
 
726 aa  695    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  60.56 
 
 
733 aa  749    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  48.97 
 
 
724 aa  629  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  47.18 
 
 
735 aa  622  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  49.72 
 
 
723 aa  597  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  44.65 
 
 
768 aa  568  1e-161  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  39.01 
 
 
700 aa  511  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  40.11 
 
 
714 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  40.62 
 
 
714 aa  504  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  37.05 
 
 
708 aa  501  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  37.05 
 
 
708 aa  501  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  37.05 
 
 
708 aa  501  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  39.4 
 
 
708 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  39.42 
 
 
718 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  41.23 
 
 
709 aa  495  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  39.4 
 
 
708 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  41.75 
 
 
709 aa  490  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  42.32 
 
 
722 aa  478  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  38.83 
 
 
707 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  39.61 
 
 
723 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  39.61 
 
 
736 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  41.45 
 
 
701 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  40.14 
 
 
728 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  36.76 
 
 
733 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  41.77 
 
 
699 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  37.57 
 
 
719 aa  375  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  38.3 
 
 
688 aa  352  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  34.31 
 
 
722 aa  325  2e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  31.54 
 
 
729 aa  324  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  31.52 
 
 
739 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  32.4 
 
 
729 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.23 
 
 
733 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  38.05 
 
 
699 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  30.67 
 
 
726 aa  302  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  31.23 
 
 
729 aa  301  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  29 
 
 
734 aa  300  8e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  32.97 
 
 
740 aa  295  3e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  32.17 
 
 
774 aa  292  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  28.01 
 
 
730 aa  292  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.92 
 
 
729 aa  290  8e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  31.82 
 
 
729 aa  284  4.0000000000000003e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  37.02 
 
 
701 aa  277  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  30.87 
 
 
818 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  32.78 
 
 
726 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  36.77 
 
 
713 aa  274  4.0000000000000004e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  27.27 
 
 
743 aa  274  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  31.57 
 
 
734 aa  274  5.000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  31.98 
 
 
750 aa  270  8e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  29.29 
 
 
713 aa  261  4e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  31.14 
 
 
726 aa  242  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  38.68 
 
 
716 aa  240  6.999999999999999e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  29.72 
 
 
730 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  29.06 
 
 
727 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  32.41 
 
 
684 aa  127  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  34.31 
 
 
530 aa  127  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  30.98 
 
 
657 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  33.42 
 
 
683 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  29.11 
 
 
669 aa  101  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  28.57 
 
 
706 aa  99.8  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  26.46 
 
 
732 aa  94  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  26.34 
 
 
723 aa  86.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  29.05 
 
 
700 aa  81.3  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.23 
 
 
674 aa  80.9  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  26.48 
 
 
679 aa  78.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  24.42 
 
 
675 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  31.13 
 
 
484 aa  60.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  25.45 
 
 
579 aa  56.2  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  23.05 
 
 
579 aa  55.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  23.93 
 
 
579 aa  55.1  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  24.71 
 
 
578 aa  54.7  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  36.14 
 
 
782 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  26.8 
 
 
562 aa  53.1  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  30.77 
 
 
589 aa  52.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  26.09 
 
 
1020 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  23.29 
 
 
505 aa  47.4  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  31.03 
 
 
541 aa  47  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.48 
 
 
510 aa  47  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  34.48 
 
 
411 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  24.06 
 
 
824 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  26.36 
 
 
429 aa  45.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>