99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0528 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  53.49 
 
 		 739 aa  828    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  62.23 
 
 		 729 aa  971    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  54.98 
 
 		 734 aa  788    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  60.33 
 
 		 726 aa  937    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 		 729 aa  1514    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  65.93 
 
 		 733 aa  1020    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  49.11 
 
 		 729 aa  739    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  51.31 
 
 		 729 aa  754    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  49.86 
 
 		 740 aa  742    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  59.62 
 
 		 734 aa  922    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  60.11 
 
 		 730 aa  919    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  51.06 
 
 		 729 aa  743    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  44.26 
 
 		 722 aa  615  1e-175  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  41.13 
 
 		 743 aa  587  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  42.69 
 
 		 726 aa  552  1e-156  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  44.98 
 
 		 750 aa  545  1e-154  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  40.17 
 
 		 818 aa  536  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  41.67 
 
 		 774 aa  534  1e-150  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  39.94 
 
 		 699 aa  489  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  34.53 
 
 		 713 aa  404  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  36.01 
 
 		 730 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  32.22 
 
 		 726 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  36.72 
 
 		 716 aa  368  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  33.53 
 
 		 727 aa  364  3e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  37.34 
 
 		 718 aa  363  8e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  32.51 
 
 		 701 aa  361  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  35.49 
 
 		 714 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  35.17 
 
 		 714 aa  353  5e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  33.06 
 
 		 708 aa  344  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  32.9 
 
 		 708 aa  342  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  32.9 
 
 		 708 aa  342  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  39.41 
 
 		 699 aa  342  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  39.4 
 
 		 701 aa  339  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  35.68 
 
 		 709 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  34.45 
 
 		 709 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  35.73 
 
 		 728 aa  335  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  34.97 
 
 		 736 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  34.91 
 
 		 723 aa  334  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  33.17 
 
 		 707 aa  328  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  35.49 
 
 		 733 aa  326  8.000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  33.73 
 
 		 708 aa  316  9e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  33.06 
 
 		 740 aa  316  9e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  33.73 
 
 		 708 aa  316  9e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.15 
 
 		 700 aa  313  4.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  32.61 
 
 		 730 aa  313  5.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  34.61 
 
 		 747 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  32.08 
 
 		 713 aa  308  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  31.56 
 
 		 727 aa  306  9.000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  35.4 
 
 		 733 aa  300  8e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  35.23 
 
 		 715 aa  300  9e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  30.99 
 
 		 724 aa  298  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  33.89 
 
 		 723 aa  297  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  32.76 
 
 		 707 aa  297  6e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.97 
 
 		 719 aa  292  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  29.11 
 
 		 724 aa  292  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  31.29 
 
 		 704 aa  292  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  35.28 
 
 		 722 aa  292  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.07 
 
 		 688 aa  290  8e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  29.61 
 
 		 721 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.09 
 
 		 735 aa  282  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  32.97 
 
 		 726 aa  280  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  29.9 
 
 		 718 aa  276  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  30.25 
 
 		 747 aa  273  6e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  31.81 
 
 		 768 aa  253  6e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.03 
 
 		 683 aa  164  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  25.71 
 
 		 684 aa  157  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  25.95 
 
 		 530 aa  150  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  26.23 
 
 		 657 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  26.68 
 
 		 669 aa  126  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  23.9 
 
 		 732 aa  112  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  24.2 
 
 		 675 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.84 
 
 		 674 aa  101  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  22.97 
 
 		 679 aa  99  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  24.84 
 
 		 706 aa  90.5  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  24.43 
 
 		 700 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  30.26 
 
 		 484 aa  72  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  25 
 
 		 723 aa  70.9  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  24.77 
 
 		 552 aa  66.2  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  25.37 
 
 		 579 aa  65.1  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  24 
 
 		 579 aa  64.3  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  24.86 
 
 		 552 aa  64.3  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  25.1 
 
 		 679 aa  62.4  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  30.91 
 
 		 562 aa  60.8  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  24.5 
 
 		 578 aa  60.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  23.08 
 
 		 505 aa  59.3  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  36.08 
 
 		 782 aa  59.3  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.26 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  22.98 
 
 		 555 aa  57  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  27.83 
 
 		 429 aa  55.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.02 
 
 		 684 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  24.63 
 
 		 694 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  32.58 
 
 		 403 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  22.45 
 
 		 579 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  33.33 
 
 		 541 aa  48.5  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0866  raffinose synthase  31.51 
 
 		 649 aa  46.2  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0843  glycosy hydrolase family protein  29.36 
 
 		 502 aa  45.8  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00330381  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  33.33 
 
 		 589 aa  45.4  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  26.5 
 
 		 1020 aa  44.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  32.18 
 
 		 471 aa  44.7  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>