101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1681 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  52.78 
 
 
700 aa  781    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  58.33 
 
 
707 aa  876    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  99.86 
 
 
708 aa  1474    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  57.73 
 
 
708 aa  861    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  100 
 
 
708 aa  1476    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 
708 aa  1476    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  57.73 
 
 
708 aa  861    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  59.6 
 
 
709 aa  892    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  60.17 
 
 
709 aa  901    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  60.08 
 
 
714 aa  920    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  60.51 
 
 
714 aa  921    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  43.39 
 
 
722 aa  578  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  40.53 
 
 
718 aa  549  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  40.11 
 
 
723 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  40.11 
 
 
736 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  38.76 
 
 
724 aa  527  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  41.52 
 
 
747 aa  527  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  38.78 
 
 
727 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  38.3 
 
 
735 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  38.45 
 
 
718 aa  505  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  39.08 
 
 
715 aa  503  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  38.21 
 
 
707 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  39.19 
 
 
733 aa  494  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  38.16 
 
 
724 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  38.29 
 
 
721 aa  492  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  38.38 
 
 
730 aa  489  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  38.35 
 
 
728 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  37.82 
 
 
733 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  37.52 
 
 
740 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  37.1 
 
 
704 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  38.67 
 
 
701 aa  468  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  36.21 
 
 
726 aa  463  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  36.9 
 
 
723 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  36.35 
 
 
719 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  35.4 
 
 
747 aa  433  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  35.69 
 
 
699 aa  417  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  36.3 
 
 
688 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  32.21 
 
 
768 aa  377  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  32.9 
 
 
729 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  30.93 
 
 
739 aa  327  3e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  32.57 
 
 
729 aa  326  7e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  35.45 
 
 
734 aa  325  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  32.91 
 
 
818 aa  325  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  30.44 
 
 
729 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  31.53 
 
 
726 aa  320  7e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  33.22 
 
 
730 aa  318  3e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  30.52 
 
 
774 aa  316  9.999999999999999e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  31.84 
 
 
726 aa  313  7.999999999999999e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.46 
 
 
733 aa  312  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  32.04 
 
 
722 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  34.12 
 
 
699 aa  302  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  32.88 
 
 
701 aa  296  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  33.03 
 
 
750 aa  294  3e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  31.7 
 
 
734 aa  293  5e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  31.73 
 
 
740 aa  289  1e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.31 
 
 
729 aa  289  1e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  31.82 
 
 
729 aa  286  1.0000000000000001e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  32.21 
 
 
713 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  30.1 
 
 
743 aa  285  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  34.66 
 
 
713 aa  275  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  33.07 
 
 
716 aa  270  5e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  28.12 
 
 
730 aa  243  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  28.29 
 
 
726 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  29.43 
 
 
727 aa  230  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  28.5 
 
 
530 aa  142  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  27.85 
 
 
684 aa  139  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.11 
 
 
683 aa  120  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  22.26 
 
 
675 aa  114  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  26.83 
 
 
657 aa  111  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  23.7 
 
 
723 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.54 
 
 
674 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  24.51 
 
 
679 aa  103  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  29.62 
 
 
706 aa  101  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  26.01 
 
 
669 aa  90.1  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  27.31 
 
 
732 aa  84.7  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  23.17 
 
 
700 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  24.82 
 
 
579 aa  69.7  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  26.14 
 
 
579 aa  67.4  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  29.03 
 
 
562 aa  66.2  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  28 
 
 
484 aa  65.1  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  28.74 
 
 
552 aa  64.3  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  28.31 
 
 
552 aa  62  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  25.56 
 
 
578 aa  60.1  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  30.77 
 
 
1020 aa  58.5  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  30.92 
 
 
782 aa  57.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  25.83 
 
 
824 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1469  glycoside hydrolase family 31  27.78 
 
 
527 aa  56.2  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000732278  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  26.21 
 
 
679 aa  55.5  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  29.37 
 
 
589 aa  55.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  23.47 
 
 
579 aa  55.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  22.49 
 
 
555 aa  54.7  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  22.58 
 
 
505 aa  51.2  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.29 
 
 
510 aa  51.2  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  34.25 
 
 
429 aa  51.2  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0843  glycosy hydrolase family protein  23.08 
 
 
502 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00330381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.87 
 
 
684 aa  50.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0375  hypothetical protein  25.42 
 
 
700 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1712  glycoside hydrolase family 31  22.8 
 
 
533 aa  47.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000051017  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  27.56 
 
 
727 aa  44.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  23.88 
 
 
589 aa  43.9  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>