60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0315 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 		 694 aa  1427    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  45.56 
 
 		 684 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  37.18 
 
 		 484 aa  88.6  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  30.38 
 
 		 579 aa  75.1  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.77 
 
 		 674 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  28.25 
 
 		 505 aa  70.5  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  30.13 
 
 		 579 aa  70.5  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  29.49 
 
 		 578 aa  67.8  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  23.42 
 
 		 675 aa  67.4  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  30.32 
 
 		 679 aa  65.1  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.29 
 
 		 733 aa  64.7  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  24.81 
 
 		 679 aa  62  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.32 
 
 		 510 aa  62  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  27.36 
 
 		 589 aa  60.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.51 
 
 		 688 aa  58.5  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  25.1 
 
 		 706 aa  57.4  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  26.35 
 
 		 552 aa  55.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  26.35 
 
 		 552 aa  55.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  24.5 
 
 		 734 aa  55.8  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  25.57 
 
 		 530 aa  55.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  26.67 
 
 		 713 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  23.62 
 
 		 555 aa  53.5  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  23.19 
 
 		 750 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  28 
 
 		 562 aa  52.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  25.12 
 
 		 729 aa  52.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  25.12 
 
 		 726 aa  52.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  26.09 
 
 		 714 aa  50.8  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  24.63 
 
 		 729 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  25.87 
 
 		 699 aa  50.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  22.46 
 
 		 723 aa  50.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  31.07 
 
 		 429 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  22.75 
 
 		 709 aa  50.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  26.09 
 
 		 714 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  30.56 
 
 		 782 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.37 
 
 		 718 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  24.32 
 
 		 579 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  29.03 
 
 		 740 aa  49.3  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  33.02 
 
 		 1020 aa  48.5  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  23.51 
 
 		 726 aa  48.5  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  30.48 
 
 		 726 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  23.81 
 
 		 727 aa  48.1  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  27.27 
 
 		 721 aa  47.8  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  31 
 
 		 818 aa  47.8  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  31.88 
 
 		 700 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0259  glycoside hydrolase family 31  26.67 
 
 		 631 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0820064 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0843  glycosy hydrolase family protein  27.64 
 
 		 502 aa  46.6  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00330381  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1469  glycoside hydrolase family 31  26.05 
 
 		 527 aa  45.8  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000732278  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  22.84 
 
 		 701 aa  45.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  20.21 
 
 		 732 aa  45.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  25 
 
 		 708 aa  44.7  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  25 
 
 		 708 aa  44.7  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  31.82 
 
 		 730 aa  44.7  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  30.21 
 
 		 730 aa  44.3  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  22.73 
 
 		 709 aa  44.3  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  22.68 
 
 		 713 aa  44.3  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4334  glycoside hydrolase family protein  25.97 
 
 		 616 aa  44.3  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  30 
 
 		 743 aa  44.3  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  30.68 
 
 		 734 aa  44.3  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.1 
 
 		 699 aa  44.3  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  24.52 
 
 		 729 aa  43.9  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>