81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0130 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 		 669 aa  1321    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  41.17 
 
 		 684 aa  456  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  41.01 
 
 		 683 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  41.34 
 
 		 657 aa  413  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  31.53 
 
 		 530 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  30.72 
 
 		 699 aa  158  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  24.86 
 
 		 713 aa  145  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  26.71 
 
 		 729 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.07 
 
 		 733 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  26.13 
 
 		 739 aa  128  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  24.45 
 
 		 722 aa  127  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  23.94 
 
 		 734 aa  124  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  23.87 
 
 		 730 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  24.03 
 
 		 818 aa  121  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  28.08 
 
 		 701 aa  120  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  28.82 
 
 		 713 aa  117  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  30.73 
 
 		 721 aa  117  8.999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  23.71 
 
 		 729 aa  114  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  21.06 
 
 		 726 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  29.75 
 
 		 730 aa  114  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  27.67 
 
 		 706 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  27 
 
 		 709 aa  112  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  23.87 
 
 		 730 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  28.43 
 
 		 701 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  27.64 
 
 		 709 aa  111  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  23.73 
 
 		 729 aa  107  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.45 
 
 		 718 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  26.04 
 
 		 708 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  29.29 
 
 		 715 aa  106  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  22.98 
 
 		 729 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  26.04 
 
 		 708 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  26.17 
 
 		 727 aa  104  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.67 
 
 		 735 aa  104  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  22.81 
 
 		 729 aa  103  9e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  24.71 
 
 		 726 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  26.67 
 
 		 708 aa  102  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.67 
 
 		 699 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  26.67 
 
 		 708 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  26.67 
 
 		 708 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  24.07 
 
 		 743 aa  101  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  28.14 
 
 		 774 aa  100  9e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  28.16 
 
 		 733 aa  100  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.5 
 
 		 707 aa  99.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  24.71 
 
 		 726 aa  100  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  22.16 
 
 		 740 aa  99  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  25.14 
 
 		 768 aa  96.3  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  25.34 
 
 		 734 aa  96.3  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.38 
 
 		 700 aa  96.3  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  26.03 
 
 		 714 aa  95.5  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  26.11 
 
 		 723 aa  94.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  26.11 
 
 		 736 aa  94.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  25.97 
 
 		 732 aa  94  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  27.96 
 
 		 714 aa  94  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  28.01 
 
 		 718 aa  92  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.34 
 
 		 688 aa  92  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  26.02 
 
 		 707 aa  91.3  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  27.7 
 
 		 728 aa  90.1  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  28.31 
 
 		 726 aa  89.7  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  31.67 
 
 		 723 aa  89  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  27.03 
 
 		 724 aa  89  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  25.56 
 
 		 724 aa  89  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  27.6 
 
 		 740 aa  88.2  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  23.72 
 
 		 722 aa  87.4  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  24.29 
 
 		 716 aa  86.7  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  27.27 
 
 		 747 aa  86.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  25.39 
 
 		 733 aa  87  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  21.75 
 
 		 727 aa  85.5  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  25.71 
 
 		 675 aa  84.7  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.13 
 
 		 719 aa  84.3  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  28.37 
 
 		 704 aa  82.4  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.89 
 
 		 674 aa  80.5  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  25.74 
 
 		 747 aa  78.2  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  23.46 
 
 		 750 aa  73.9  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  23.39 
 
 		 723 aa  70.5  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  24.3 
 
 		 679 aa  67.8  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  23.48 
 
 		 700 aa  60.5  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  24.65 
 
 		 578 aa  54.7  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  24.92 
 
 		 679 aa  51.2  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  23.64 
 
 		 694 aa  45.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  34.74 
 
 		 407 aa  45.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  25.34 
 
 		 824 aa  44.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.321699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>