101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1936 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  57.55 
 
 		 774 aa  957    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 		 818 aa  1712    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  39.03 
 
 		 739 aa  543  1e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  39.94 
 
 		 733 aa  536  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  40.17 
 
 		 729 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  38.69 
 
 		 729 aa  532  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  38.46 
 
 		 743 aa  521  1e-146  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  38.58 
 
 		 726 aa  522  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  38.45 
 
 		 734 aa  503  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  38.87 
 
 		 730 aa  500  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  36.73 
 
 		 729 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  37.69 
 
 		 740 aa  488  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  39.35 
 
 		 729 aa  482  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  38.06 
 
 		 734 aa  476  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  36.19 
 
 		 729 aa  466  9.999999999999999e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  36.85 
 
 		 722 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  35.91 
 
 		 750 aa  409  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.261984 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  34.82 
 
 		 726 aa  395  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  34.15 
 
 		 713 aa  335  2e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  32.76 
 
 		 699 aa  335  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  34.93 
 
 		 718 aa  334  5e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  31.98 
 
 		 701 aa  327  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  32.91 
 
 		 708 aa  325  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  32.91 
 
 		 708 aa  325  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  32.91 
 
 		 708 aa  325  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  35.7 
 
 		 730 aa  317  6e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  32.92 
 
 		 723 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  32.92 
 
 		 736 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  30.82 
 
 		 714 aa  306  8.000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  33.59 
 
 		 714 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  33.91 
 
 		 709 aa  304  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  38.17 
 
 		 733 aa  303  7.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.48 
 
 		 707 aa  300  5e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  32.7 
 
 		 709 aa  300  9e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  32.37 
 
 		 747 aa  298  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  33.97 
 
 		 727 aa  298  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  33.89 
 
 		 701 aa  296  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  32.57 
 
 		 728 aa  293  8e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  36.78 
 
 		 716 aa  292  1e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  36.24 
 
 		 699 aa  291  4e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  34.42 
 
 		 700 aa  290  5.0000000000000004e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  33 
 
 		 724 aa  286  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  32.66 
 
 		 726 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  30.38 
 
 		 722 aa  284  5.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.93 
 
 		 719 aa  281  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  32.04 
 
 		 708 aa  279  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  32.04 
 
 		 708 aa  279  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.76 
 
 		 735 aa  277  6e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  32.56 
 
 		 727 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  30.64 
 
 		 730 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  32.11 
 
 		 733 aa  268  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  33.41 
 
 		 726 aa  268  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  30.91 
 
 		 715 aa  266  8e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  29.73 
 
 		 721 aa  266  8.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  32.33 
 
 		 713 aa  266  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.55 
 
 		 688 aa  261  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  33.89 
 
 		 724 aa  260  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  32.56 
 
 		 704 aa  260  7e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  33.48 
 
 		 707 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  32.22 
 
 		 740 aa  257  5e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  34.42 
 
 		 768 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  32.75 
 
 		 718 aa  246  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  31.6 
 
 		 747 aa  244  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  30.22 
 
 		 723 aa  234  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  28.54 
 
 		 530 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  25.25 
 
 		 684 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.47 
 
 		 683 aa  117  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  25.46 
 
 		 657 aa  111  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  24.24 
 
 		 669 aa  108  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  25.97 
 
 		 732 aa  103  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  25.7 
 
 		 700 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.71 
 
 		 674 aa  97.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  22.84 
 
 		 675 aa  90.1  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  22.47 
 
 		 706 aa  87.8  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  22.99 
 
 		 679 aa  82.4  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  25.94 
 
 		 578 aa  76.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  30.22 
 
 		 562 aa  76.6  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  29.79 
 
 		 484 aa  76.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  21.87 
 
 		 723 aa  73.9  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  24.26 
 
 		 579 aa  69.3  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  27.11 
 
 		 824 aa  68.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  22.11 
 
 		 579 aa  67.4  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  26.89 
 
 		 679 aa  65.5  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  23.39 
 
 		 555 aa  64.7  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  28.93 
 
 		 589 aa  64.3  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  33.66 
 
 		 1020 aa  61.6  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  29.73 
 
 		 782 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  28.26 
 
 		 552 aa  58.2  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  28.26 
 
 		 552 aa  58.2  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.15 
 
 		 510 aa  54.7  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.69 
 
 		 684 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  20.98 
 
 		 579 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  24.34 
 
 		 505 aa  53.5  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  24.49 
 
 		 429 aa  48.5  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  30.34 
 
 		 407 aa  47.8  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  31 
 
 		 694 aa  47.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  28.09 
 
 		 403 aa  47  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  26.37 
 
 		 568 aa  46.6  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  31.4 
 
 		 411 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0866  raffinose synthase  34.57 
 
 		 649 aa  45.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>