106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1878 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  100 
 
 		 699 aa  1399    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  46.14 
 
 		 728 aa  587  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  40.95 
 
 		 723 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  40.81 
 
 		 736 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  40.4 
 
 		 701 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  38.92 
 
 		 707 aa  442  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  35.98 
 
 		 700 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  36.52 
 
 		 708 aa  425  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  36.52 
 
 		 708 aa  425  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  35.55 
 
 		 718 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  38.46 
 
 		 709 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  39.5 
 
 		 709 aa  422  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  35.69 
 
 		 708 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  35.69 
 
 		 708 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  35.69 
 
 		 708 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  37.61 
 
 		 714 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  37.72 
 
 		 714 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  36.72 
 
 		 722 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  43.17 
 
 		 747 aa  385  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  39.97 
 
 		 718 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  40.26 
 
 		 726 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  41.02 
 
 		 733 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  37.62 
 
 		 721 aa  375  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  41.77 
 
 		 730 aa  372  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  39.44 
 
 		 707 aa  372  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  36.58 
 
 		 735 aa  369  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  36.71 
 
 		 724 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  39.9 
 
 		 727 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  40.43 
 
 		 704 aa  365  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  40.84 
 
 		 733 aa  363  5.0000000000000005e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  38.44 
 
 		 723 aa  363  7.0000000000000005e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  40.45 
 
 		 724 aa  356  8.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  36.8 
 
 		 715 aa  353  4e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  36.82 
 
 		 740 aa  349  9e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  36.08 
 
 		 688 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  35.44 
 
 		 719 aa  342  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  39.41 
 
 		 729 aa  342  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  34.6 
 
 		 733 aa  336  7e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  35.73 
 
 		 740 aa  318  2e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  32.67 
 
 		 729 aa  316  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  36.41 
 
 		 734 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  34.58 
 
 		 722 aa  310  4e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  36.61 
 
 		 768 aa  310  6.999999999999999e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  35.82 
 
 		 729 aa  310  8e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  29.55 
 
 		 730 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  38.96 
 
 		 701 aa  306  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  29.55 
 
 		 734 aa  305  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  30.17 
 
 		 743 aa  304  4.0000000000000003e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  36.18 
 
 		 726 aa  301  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.41 
 
 		 729 aa  300  4e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  34.61 
 
 		 747 aa  300  5e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  33.56 
 
 		 726 aa  298  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  35.65 
 
 		 729 aa  295  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  36.19 
 
 		 739 aa  293  5e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  36.24 
 
 		 818 aa  291  3e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  33.33 
 
 		 774 aa  289  9e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  36.49 
 
 		 699 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  33.33 
 
 		 750 aa  275  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  34.04 
 
 		 713 aa  268  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  34.56 
 
 		 716 aa  260  5.0000000000000005e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  29.04 
 
 		 730 aa  252  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  34.96 
 
 		 713 aa  245  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  25.14 
 
 		 726 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  30.58 
 
 		 727 aa  232  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 		 530 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.77 
 
 		 683 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  29.87 
 
 		 684 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  25.73 
 
 		 657 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  29.1 
 
 		 732 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  26.94 
 
 		 706 aa  94  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  29.71 
 
 		 669 aa  85.1  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.27 
 
 		 674 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  26.56 
 
 		 679 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  27.72 
 
 		 675 aa  82.4  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  24.64 
 
 		 700 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  25.29 
 
 		 579 aa  64.7  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 		 484 aa  63.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  25.62 
 
 		 578 aa  60.1  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  24.26 
 
 		 579 aa  58.5  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  24.19 
 
 		 723 aa  55.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  27.36 
 
 		 562 aa  55.1  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  31.25 
 
 		 604 aa  55.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  33.7 
 
 		 411 aa  54.7  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  28.19 
 
 		 1020 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.43 
 
 		 684 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  27.84 
 
 		 567 aa  52.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  24.77 
 
 		 824 aa  50.8  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  30.21 
 
 		 407 aa  50.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  29.89 
 
 		 471 aa  49.7  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  25.45 
 
 		 541 aa  48.9  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  27.5 
 
 		 679 aa  48.1  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  29.67 
 
 		 568 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  31.46 
 
 		 387 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  29.17 
 
 		 548 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  31.52 
 
 		 403 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  23.77 
 
 		 727 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  27.53 
 
 		 429 aa  45.8  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  23.2 
 
 		 579 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  29.21 
 
 		 408 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  23.65 
 
 		 552 aa  45.4  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>