94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1749 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  52.52 
 
 
724 aa  649    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 
724 aa  1458    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  80.3 
 
 
735 aa  1210    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  49.8 
 
 
727 aa  647    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  50.07 
 
 
707 aa  634  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  49.38 
 
 
715 aa  619  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  50.82 
 
 
733 aa  620  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  47.67 
 
 
721 aa  612  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  47.23 
 
 
747 aa  598  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  47.76 
 
 
726 aa  601  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  48.02 
 
 
704 aa  599  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  48.5 
 
 
730 aa  593  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  47.9 
 
 
747 aa  593  1e-168  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  45.87 
 
 
718 aa  580  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  45 
 
 
740 aa  577  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  41.84 
 
 
709 aa  535  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  40.69 
 
 
714 aa  532  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  40.57 
 
 
707 aa  527  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  38.76 
 
 
708 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  38.76 
 
 
708 aa  527  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  38.76 
 
 
708 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  42.11 
 
 
709 aa  527  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  39.75 
 
 
700 aa  522  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  40 
 
 
714 aa  524  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  40.69 
 
 
708 aa  522  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  43.03 
 
 
723 aa  520  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  40.69 
 
 
708 aa  522  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  38.07 
 
 
718 aa  497  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  40.83 
 
 
768 aa  488  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  40.5 
 
 
722 aa  481  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  41.57 
 
 
736 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  41.72 
 
 
723 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  38.88 
 
 
728 aa  426  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  37.89 
 
 
701 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  37.33 
 
 
733 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  38.16 
 
 
688 aa  389  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  36.71 
 
 
699 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  36.06 
 
 
719 aa  347  6e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  31.11 
 
 
729 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  35.07 
 
 
733 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  29.66 
 
 
726 aa  299  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  29.53 
 
 
734 aa  299  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  30.32 
 
 
739 aa  298  2e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  33.46 
 
 
722 aa  293  1e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  32.09 
 
 
774 aa  293  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  29.11 
 
 
729 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  33.8 
 
 
734 aa  292  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  34.16 
 
 
729 aa  291  3e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  28.55 
 
 
730 aa  289  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  33 
 
 
818 aa  286  1.0000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  33.69 
 
 
713 aa  285  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  34.15 
 
 
699 aa  278  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  31.76 
 
 
743 aa  276  7e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  32.07 
 
 
726 aa  276  9e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  31.08 
 
 
740 aa  271  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.36 
 
 
729 aa  270  8e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  29.37 
 
 
713 aa  268  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  30.7 
 
 
750 aa  265  3e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  27.58 
 
 
729 aa  252  2e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  34.49 
 
 
701 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  28.75 
 
 
727 aa  227  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  33.2 
 
 
716 aa  225  3e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  29.82 
 
 
730 aa  223  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  26.99 
 
 
726 aa  197  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  32.35 
 
 
684 aa  151  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  34.19 
 
 
530 aa  142  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.41 
 
 
683 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  25.97 
 
 
657 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  24.68 
 
 
723 aa  94  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  25.47 
 
 
675 aa  92  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  24.05 
 
 
706 aa  90.1  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  26.82 
 
 
732 aa  88.2  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  25.68 
 
 
700 aa  87.4  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.39 
 
 
674 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  25.55 
 
 
669 aa  76.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  24.24 
 
 
679 aa  75.5  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  26.79 
 
 
579 aa  64.7  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  25.35 
 
 
579 aa  60.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  24.62 
 
 
562 aa  56.2  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  25.76 
 
 
589 aa  54.3  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  26.19 
 
 
484 aa  53.5  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.43 
 
 
684 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  25.57 
 
 
505 aa  50.8  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  26.44 
 
 
578 aa  50.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  36.78 
 
 
411 aa  48.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  31.46 
 
 
727 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  26.45 
 
 
552 aa  45.8  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  26.45 
 
 
552 aa  45.8  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  26.06 
 
 
824 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  31.37 
 
 
693 aa  45.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.17 
 
 
510 aa  44.7  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0843  glycosy hydrolase family protein  24.86 
 
 
502 aa  44.7  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00330381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  28.7 
 
 
429 aa  44.3  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1469  glycoside hydrolase family 31  24.67 
 
 
527 aa  44.3  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000732278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>