102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0943 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 
713 aa  1389    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  40.03 
 
 
699 aa  387  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  40.09 
 
 
701 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  34.72 
 
 
713 aa  356  6.999999999999999e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  35.53 
 
 
734 aa  313  9e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  31.91 
 
 
729 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  32.08 
 
 
729 aa  308  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  30.11 
 
 
726 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.15 
 
 
733 aa  306  9.000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  36.44 
 
 
728 aa  300  8e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  30.6 
 
 
734 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  36.59 
 
 
709 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  35.36 
 
 
701 aa  297  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  30.6 
 
 
730 aa  296  6e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  33.28 
 
 
718 aa  293  7e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  36.47 
 
 
718 aa  286  5.999999999999999e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  32.21 
 
 
708 aa  286  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  32.21 
 
 
708 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  32.21 
 
 
708 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  33.69 
 
 
724 aa  285  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  34.57 
 
 
709 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  34.3 
 
 
714 aa  284  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  32.69 
 
 
714 aa  282  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  33.58 
 
 
708 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  33.58 
 
 
708 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  30.46 
 
 
729 aa  280  7e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  33.7 
 
 
707 aa  277  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  33.55 
 
 
735 aa  276  7e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  32.65 
 
 
723 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  32.65 
 
 
736 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  30.21 
 
 
722 aa  272  2e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  29.83 
 
 
739 aa  270  8e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  36.5 
 
 
730 aa  270  8e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  37.38 
 
 
715 aa  266  8e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  32.33 
 
 
818 aa  266  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  33.91 
 
 
724 aa  266  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  31.47 
 
 
726 aa  264  3e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  36.67 
 
 
707 aa  262  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  36.41 
 
 
726 aa  262  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  31.41 
 
 
740 aa  261  4e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.12 
 
 
700 aa  261  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.63887 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  31.33 
 
 
750 aa  260  6e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  33.39 
 
 
716 aa  260  7e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  30.34 
 
 
774 aa  258  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  33.04 
 
 
733 aa  259  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  26.93 
 
 
743 aa  256  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  38.66 
 
 
733 aa  254  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  30.57 
 
 
729 aa  250  5e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  33.27 
 
 
747 aa  250  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  26.92 
 
 
730 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  34.4 
 
 
727 aa  246  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  34.96 
 
 
699 aa  245  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  35.08 
 
 
740 aa  244  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  35.45 
 
 
704 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  34.55 
 
 
721 aa  241  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.43 
 
 
729 aa  240  5.999999999999999e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  31.72 
 
 
722 aa  239  9e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  26.64 
 
 
726 aa  236  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  32.94 
 
 
723 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.27 
 
 
719 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  31.99 
 
 
747 aa  221  3.9999999999999997e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.96 
 
 
688 aa  219  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  36.56 
 
 
768 aa  209  1e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  27.72 
 
 
727 aa  209  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  31.88 
 
 
530 aa  159  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  29.21 
 
 
657 aa  132  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  27.93 
 
 
684 aa  128  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.29 
 
 
683 aa  121  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.31 
 
 
674 aa  114  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  25.83 
 
 
732 aa  109  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  25 
 
 
675 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  28.8 
 
 
679 aa  103  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  28.47 
 
 
669 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  24.95 
 
 
706 aa  93.2  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  29.97 
 
 
484 aa  88.6  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  23.95 
 
 
723 aa  85.5  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  24.36 
 
 
700 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  30.16 
 
 
505 aa  77  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  28.35 
 
 
552 aa  74.3  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  29.82 
 
 
552 aa  72.8  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  28.65 
 
 
579 aa  72.4  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  29.3 
 
 
562 aa  71.6  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.03 
 
 
510 aa  71.6  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  26.38 
 
 
579 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  28.92 
 
 
578 aa  66.6  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  33.09 
 
 
589 aa  63.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  28.88 
 
 
782 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  24.1 
 
 
555 aa  60.8  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  27.4 
 
 
679 aa  57.4  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  29.91 
 
 
1020 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  26.67 
 
 
694 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0375  hypothetical protein  29.84 
 
 
700 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  28.03 
 
 
579 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  24.54 
 
 
824 aa  51.6  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  33.65 
 
 
429 aa  51.6  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  35.29 
 
 
684 aa  50.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  32.26 
 
 
411 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  26.52 
 
 
548 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  35.56 
 
 
693 aa  48.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  33.33 
 
 
407 aa  46.2  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>