36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0375 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0375  hypothetical protein  100 
 
 		 700 aa  1450    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  28 
 
 		 747 aa  57.4  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  33.88 
 
 		 701 aa  55.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  29.84 
 
 		 713 aa  53.9  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  34.11 
 
 		 718 aa  53.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  32.77 
 
 		 723 aa  51.2  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  29.93 
 
 		 733 aa  51.2  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.5 
 
 		 719 aa  51.2  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  29.71 
 
 		 699 aa  50.8  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  26.61 
 
 		 726 aa  50.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  25.42 
 
 		 708 aa  50.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  25.42 
 
 		 708 aa  50.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  25.42 
 
 		 708 aa  50.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  36.84 
 
 		 707 aa  48.9  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  28.91 
 
 		 724 aa  48.5  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  32.1 
 
 		 708 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  32.1 
 
 		 708 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  30.91 
 
 		 743 aa  47.4  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  28.99 
 
 		 715 aa  47  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  28.86 
 
 		 726 aa  46.6  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  31.07 
 
 		 727 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  34.72 
 
 		 713 aa  46.2  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  34.72 
 
 		 709 aa  45.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  29.17 
 
 		 701 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  29.03 
 
 		 747 aa  45.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  34.72 
 
 		 709 aa  45.4  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  31.96 
 
 		 721 aa  45.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  34.02 
 
 		 704 aa  45.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  29.59 
 
 		 714 aa  45.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  34.19 
 
 		 728 aa  44.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  29.59 
 
 		 714 aa  44.7  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  36.23 
 
 		 722 aa  44.7  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.65 
 
 		 718 aa  44.7  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.39 
 
 		 735 aa  44.3  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  34.55 
 
 		 726 aa  43.9  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  29.19 
 
 		 774 aa  43.9  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>