100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1331 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  69.63 
 
 		 708 aa  1038    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  54.04 
 
 		 700 aa  782    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  71.33 
 
 		 714 aa  1047    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  92.1 
 
 		 709 aa  1350    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  70.1 
 
 		 707 aa  1048    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 		 709 aa  1446    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  59.46 
 
 		 708 aa  891    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  70.96 
 
 		 714 aa  1046    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  69.63 
 
 		 708 aa  1038    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  59.6 
 
 		 708 aa  892    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  59.6 
 
 		 708 aa  892    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  47.06 
 
 		 722 aa  606  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  42.17 
 
 		 718 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  42.58 
 
 		 723 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  42.58 
 
 		 736 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  41.23 
 
 		 735 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  43.71 
 
 		 721 aa  530  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  41.86 
 
 		 727 aa  531  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  42.11 
 
 		 724 aa  527  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  45.17 
 
 		 715 aa  522  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  44.13 
 
 		 728 aa  515  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  44.54 
 
 		 747 aa  510  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  43.78 
 
 		 724 aa  501  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  41.55 
 
 		 704 aa  489  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  42.49 
 
 		 726 aa  489  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  42.8 
 
 		 733 aa  488  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  40.66 
 
 		 718 aa  480  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  42.21 
 
 		 707 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  42.43 
 
 		 730 aa  475  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  40.32 
 
 		 740 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  42.02 
 
 		 701 aa  462  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  40.91 
 
 		 723 aa  455  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  39.83 
 
 		 747 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  38.56 
 
 		 719 aa  443  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  40.2 
 
 		 733 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  38.46 
 
 		 699 aa  419  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  36.76 
 
 		 688 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  37.1 
 
 		 768 aa  377  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  35.68 
 
 		 729 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  31.48 
 
 		 729 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  31.95 
 
 		 726 aa  321  3e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.84 
 
 		 733 aa  320  7.999999999999999e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  32.57 
 
 		 739 aa  318  3e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  31.06 
 
 		 734 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  32.34 
 
 		 729 aa  313  7.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  31.81 
 
 		 730 aa  312  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  31.83 
 
 		 750 aa  310  6.999999999999999e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  32.47 
 
 		 740 aa  310  9e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  33.1 
 
 		 722 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  34.39 
 
 		 726 aa  305  2.0000000000000002e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  36.1 
 
 		 699 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  32.7 
 
 		 818 aa  300  8e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  36.59 
 
 		 713 aa  298  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  33.27 
 
 		 729 aa  295  3e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  36.21 
 
 		 734 aa  291  4e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  29.81 
 
 		 743 aa  286  7e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.07 
 
 		 729 aa  286  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  34.13 
 
 		 701 aa  285  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  33.39 
 
 		 716 aa  283  5.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  31.15 
 
 		 774 aa  279  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  33.85 
 
 		 713 aa  276  1.0000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  28.32 
 
 		 730 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  26.76 
 
 		 726 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  30.42 
 
 		 727 aa  225  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  30.63 
 
 		 684 aa  140  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  32.16 
 
 		 657 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  30 
 
 		 530 aa  124  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.77 
 
 		 683 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  26.1 
 
 		 675 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  26.41 
 
 		 669 aa  99.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.74 
 
 		 674 aa  99  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  28.08 
 
 		 706 aa  93.6  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  22.86 
 
 		 700 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  26.22 
 
 		 732 aa  82.8  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  25 
 
 		 723 aa  79  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  26.62 
 
 		 679 aa  75.5  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  24.5 
 
 		 579 aa  66.6  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  26.09 
 
 		 579 aa  65.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  31.01 
 
 		 484 aa  63.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  30.53 
 
 		 578 aa  63.9  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  28.03 
 
 		 562 aa  60.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  29.51 
 
 		 589 aa  58.2  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1469  glycoside hydrolase family 31  29.41 
 
 		 527 aa  57.4  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000732278  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  29.66 
 
 		 1020 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  23.33 
 
 		 679 aa  53.9  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  23.84 
 
 		 505 aa  53.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  32.33 
 
 		 782 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  24.12 
 
 		 579 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0843  glycosy hydrolase family protein  23.41 
 
 		 502 aa  52  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00330381  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45442  predicted protein  21.77 
 
 		 430 aa  50.8  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000628338  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  22.75 
 
 		 694 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  31.03 
 
 		 411 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  29.66 
 
 		 552 aa  48.1  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.89 
 
 		 684 aa  48.1  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  29.66 
 
 		 552 aa  48.1  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  32.08 
 
 		 693 aa  47.4  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  24.64 
 
 		 824 aa  47.4  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0375  hypothetical protein  34.72 
 
 		 700 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1712  glycoside hydrolase family 31  25.16 
 
 		 533 aa  45.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000051017  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.37 
 
 		 510 aa  44.7  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>