152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2208 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  100 
 
 		 1869 aa  3624    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07135  RHGB_ASPAC Rhamnogalacturonase B (Rhamnogalacturonan lyase) (RGase B) (RHG B) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AX45]  43.22 
 
 		 527 aa  394  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.166674 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02430  rhamnogalacturonase B  41.74 
 
 		 533 aa  364  8e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.521572  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03950  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  37.68 
 
 		 522 aa  251  9e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.551078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  46.5 
 
 		 2802 aa  121  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  30.6 
 
 		 3391 aa  116  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  39.13 
 
 		 3325 aa  95.1  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.5 
 
 		 3552 aa  80.9  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  28.73 
 
 		 3824 aa  77.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  55.13 
 
 		 887 aa  77.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  32.99 
 
 		 2906 aa  76.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  27.95 
 
 		 3824 aa  75.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  28.28 
 
 		 3721 aa  75.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  28.28 
 
 		 3739 aa  75.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  28.96 
 
 		 3824 aa  74.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  35.96 
 
 		 1004 aa  74.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0264  beta strand repeat-containing protein  46.72 
 
 		 860 aa  73.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  34.62 
 
 		 5561 aa  73.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  34.62 
 
 		 5561 aa  73.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  37.78 
 
 		 3563 aa  72.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  33.97 
 
 		 5561 aa  72.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  33.97 
 
 		 5559 aa  72.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  33.97 
 
 		 5559 aa  72.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  40 
 
 		 3562 aa  71.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04139  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  25.09 
 
 		 1041 aa  71.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.839172  normal  0.276686 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  34.05 
 
 		 2456 aa  70.1  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  31.28 
 
 		 2578 aa  70.1  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  38.61 
 
 		 4106 aa  69.7  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  53.85 
 
 		 2636 aa  69.7  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  44.57 
 
 		 2522 aa  69.3  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40 
 
 		 1848 aa  69.3  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  46.92 
 
 		 1001 aa  68.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  35.04 
 
 		 1108 aa  68.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  57.38 
 
 		 1439 aa  68.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  43.97 
 
 		 1991 aa  67.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  34.5 
 
 		 3204 aa  67  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  48.25 
 
 		 1001 aa  66.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  30.7 
 
 		 852 aa  66.6  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  42.37 
 
 		 1033 aa  66.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  35.48 
 
 		 986 aa  66.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  48.65 
 
 		 983 aa  66.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  42.86 
 
 		 1028 aa  65.5  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  43.22 
 
 		 1055 aa  65.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  36.75 
 
 		 2911 aa  65.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  32.35 
 
 		 816 aa  65.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  32.56 
 
 		 6779 aa  64.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  46.85 
 
 		 995 aa  64.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  32.56 
 
 		 6662 aa  64.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  33.49 
 
 		 1779 aa  63.9  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  36.61 
 
 		 995 aa  63.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.56 
 
 		 6683 aa  63.9  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  30.4 
 
 		 1881 aa  62.4  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  45.95 
 
 		 991 aa  62  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.42 
 
 		 1586 aa  60.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  31.1 
 
 		 2768 aa  60.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  38.32 
 
 		 1180 aa  60.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1258  beta strand repeat-containing protein  39.61 
 
 		 550 aa  60.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305666  normal  0.49742 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  49.45 
 
 		 3015 aa  60.5  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  39.31 
 
 		 2926 aa  59.7  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  33.64 
 
 		 2625 aa  59.7  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.35 
 
 		 1029 aa  59.3  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0910  Rhamnogalacturonate lyase  23.77 
 
 		 571 aa  58.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  47.31 
 
 		 2042 aa  58.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  53.25 
 
 		 882 aa  58.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  32.46 
 
 		 3506 aa  58.2  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  29.73 
 
 		 4791 aa  58.2  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  36.89 
 
 		 1848 aa  58.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  43.4 
 
 		 1081 aa  57.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  37.95 
 
 		 2704 aa  57.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  37.65 
 
 		 965 aa  57.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  34.46 
 
 		 3314 aa  57  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.67 
 
 		 910 aa  57  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  41.46 
 
 		 1177 aa  57  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.19 
 
 		 3699 aa  57.4  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0682  Rhamnogalacturonate lyase  24.44 
 
 		 576 aa  57  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  47.19 
 
 		 3544 aa  56.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  30.23 
 
 		 7149 aa  56.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  36.88 
 
 		 2711 aa  56.6  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.24 
 
 		 1285 aa  56.2  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06395  Rhamnogalacturonan lyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS3]  24.42 
 
 		 664 aa  55.8  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.824866  normal  0.241878 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  29.78 
 
 		 1971 aa  55.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4114  hypothetical protein  34.71 
 
 		 747 aa  55.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  33.51 
 
 		 1741 aa  55.5  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  46.07 
 
 		 2503 aa  55.5  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  37.04 
 
 		 658 aa  55.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  46.07 
 
 		 3699 aa  55.5  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  39.73 
 
 		 2407 aa  54.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.33 
 
 		 1322 aa  54.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  29.82 
 
 		 5442 aa  53.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  61.4 
 
 		 1804 aa  53.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  49.25 
 
 		 815 aa  53.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0531  hypothetical protein  30.18 
 
 		 850 aa  52.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744468  normal  0.643161 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  25.82 
 
 		 2057 aa  52.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  32.43 
 
 		 5080 aa  52.4  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  37.71 
 
 		 1068 aa  52.4  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  37.04 
 
 		 909 aa  52  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.82 
 
 		 5839 aa  51.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  31.61 
 
 		 857 aa  52  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  31.68 
 
 		 2402 aa  51.2  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  29.58 
 
 		 1099 aa  51.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>