18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_04139 on replicon BN001302
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06395  Rhamnogalacturonan lyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS3]  53.04 
 
 
664 aa  647    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.824866  normal  0.241878 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04139  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  100 
 
 
1041 aa  2172    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.839172  normal  0.276686 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04250  expressed protein  42.04 
 
 
606 aa  432  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.583211  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02476  phosphoric ester hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03130)  34.43 
 
 
365 aa  141  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10532  Ser/Thr protein phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06000)  37.39 
 
 
385 aa  130  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.846198 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1331  metallophosphoesterase  41.24 
 
 
215 aa  126  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.174892  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01360  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.11 
 
 
209 aa  124  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1287  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.21 
 
 
211 aa  122  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0200  metallophosphoesterase  36.98 
 
 
210 aa  119  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00464  Ser/Thr protein phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04330)  29.84 
 
 
279 aa  100  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.357833  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0682  Rhamnogalacturonate lyase  24.04 
 
 
576 aa  87  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0910  Rhamnogalacturonate lyase  22.5 
 
 
571 aa  84.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3231  Rhamnogalacturonate lyase  24.18 
 
 
580 aa  83.2  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2152  Rhamnogalacturonate lyase  24.59 
 
 
605 aa  79.3  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02430  rhamnogalacturonase B  24.31 
 
 
533 aa  72.8  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.521572  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  24.61 
 
 
1869 aa  65.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3047  metallophosphoesterase  29.5 
 
 
200 aa  53.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03950  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  26.06 
 
 
522 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.551078  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>