27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1287 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1287  Ser/Thr protein phosphatase family protein  100 
 
 
211 aa  438  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1331  metallophosphoesterase  51.9 
 
 
215 aa  226  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.174892  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0200  metallophosphoesterase  50.48 
 
 
210 aa  223  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01360  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.54 
 
 
209 aa  142  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04139  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  40.21 
 
 
1041 aa  122  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.839172  normal  0.276686 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00464  Ser/Thr protein phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04330)  33.33 
 
 
279 aa  106  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.357833  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10532  Ser/Thr protein phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06000)  32.57 
 
 
385 aa  100  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.846198 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3047  metallophosphoesterase  28.93 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02476  phosphoric ester hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03130)  26.87 
 
 
365 aa  85.1  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3062  metallophosphoesterase  27.11 
 
 
202 aa  57.4  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27593  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0682  metallophosphoesterase  29.58 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0388677  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0339  metallophosphoesterase  25.87 
 
 
221 aa  56.6  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0897854  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1203  metallophosphoesterase  27.94 
 
 
226 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2514  serine/threonine protein phosphatase family protein  27.96 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.221485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3228  hypothetical protein  27.32 
 
 
219 aa  48.9  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00856854  normal  0.0495142 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1372  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.1 
 
 
207 aa  48.1  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0270  metallophosphoesterase  25.46 
 
 
208 aa  45.8  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.407111  normal  0.0834706 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0932  metallophosphoesterase  29.95 
 
 
213 aa  45.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.205067  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0035  metallophosphoesterase  25 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.525214  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3641  metallophosphoesterase  25.53 
 
 
217 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0083  metallophosphoesterase  25 
 
 
286 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2740  metallophosphoesterase  33.66 
 
 
242 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.446767  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1743  metallophosphoesterase  24.14 
 
 
214 aa  42.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.97747  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0758  metallophosphoesterase  34.57 
 
 
425 aa  42  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0695  metallophosphoesterase  38 
 
 
222 aa  41.6  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0227916  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1145  hypothetical protein  26.77 
 
 
225 aa  41.6  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.890478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4012  hypothetical protein  46 
 
 
218 aa  41.6  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>