29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3641 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3641  metallophosphoesterase  100 
 
 		 217 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577036 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2890  metallophosphoesterase  76.44 
 
 		 221 aa  348  4e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.27 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2620  metallophosphoesterase  31.86 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.534657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4568  hypothetical protein  24.23 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.655382 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0682  metallophosphoesterase  24.31 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0388677  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2852  putative integral membrane protein  26.32 
 
 		 537 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3461  metallophosphoesterase  25.76 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4366  metallophosphoesterase  23.24 
 
 		 489 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5021  metallophosphoesterase  26.63 
 
 		 244 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.745206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5252  metallophosphoesterase  26.63 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3115  metallophosphoesterase  26.63 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4738  metallophosphoesterase  26.15 
 
 		 513 aa  45.1  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.203482  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4612  metallophosphoesterase  24.62 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5140  metallophosphoesterase  24.62 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0401  metallophosphoesterase  27.23 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1279  phosphodiesterase YaeI  23.79 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1287  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.53 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  23.11 
 
 		 373 aa  42.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  22.82 
 
 		 374 aa  42.7  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  23.11 
 
 		 373 aa  42.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0198  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.57 
 
 		 337 aa  42.4  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.101077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4534  metallophosphoesterase  23.56 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2697  phosphoesterase related to the Icc protein-like protein  24.22 
 
 		 261 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  23.95 
 
 		 381 aa  42  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0545  metallophosphoesterase  27.82 
 
 		 544 aa  42  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2244  metallophosphoesterase  35.06 
 
 		 282 aa  41.6  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3050  metallophosphoesterase  24.2 
 
 		 255 aa  41.6  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000443349  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  25.41 
 
 		 275 aa  41.6  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>