30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4738 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4738  metallophosphoesterase  100 
 
 
513 aa  986    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.203482  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1223  metallophosphoesterase  46.77 
 
 
546 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.148562  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1115  metallophosphoesterase  47.65 
 
 
526 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190762  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9057  hypothetical protein  43.66 
 
 
499 aa  343  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0545  metallophosphoesterase  44.21 
 
 
544 aa  330  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4366  metallophosphoesterase  39.87 
 
 
489 aa  329  8e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2852  putative integral membrane protein  43.19 
 
 
537 aa  323  5e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3363  metallophosphoesterase  38.66 
 
 
532 aa  306  7e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4458  metallophosphoesterase  40.45 
 
 
514 aa  272  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0868  metallophosphoesterase  40.46 
 
 
544 aa  257  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00146692  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11330  predicted phosphohydrolase  37.34 
 
 
537 aa  249  6e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513687  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1242  metallophosphoesterase  31.85 
 
 
499 aa  171  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.163167  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1472  metallophosphoesterase  29.49 
 
 
466 aa  163  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.114222  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2226  hypothetical protein  28.76 
 
 
489 aa  154  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1715  metallophosphoesterase  34.91 
 
 
577 aa  86.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.942049  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2227  metallophosphoesterase  33.92 
 
 
699 aa  79  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13180  hypothetical protein  33.33 
 
 
635 aa  77  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0785963  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1571  metallophosphoesterase  29.03 
 
 
645 aa  60.5  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2238  metallophosphoesterase  35.58 
 
 
663 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.771781  hitchhiker  0.00997519 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1132  cytoplasmic membrane protein  27.92 
 
 
370 aa  55.1  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00503148  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1153  cytoplasmic membrane protein  25.14 
 
 
369 aa  53.5  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.199237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1285  metallophosphoesterase  27.31 
 
 
474 aa  51.6  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.645339  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1743  metallophosphoesterase  26.5 
 
 
214 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.97747  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3641  metallophosphoesterase  26.15 
 
 
217 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577036 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1553  acyl carrier protein  26.86 
 
 
370 aa  46.2  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2739  metallophosphoesterase  27.8 
 
 
276 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30101 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1383  metallophosphoesterase  24.29 
 
 
365 aa  44.7  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1653  metallophosphoesterase  29.66 
 
 
258 aa  44.3  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0186  metallophosphoesterase  25.85 
 
 
403 aa  44.3  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1218  metallophosphoesterase  25.56 
 
 
366 aa  43.5  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0970126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>