40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3363 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3363  metallophosphoesterase  100 
 
 
532 aa  1073    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9057  hypothetical protein  50.87 
 
 
499 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2852  putative integral membrane protein  47.92 
 
 
537 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0545  metallophosphoesterase  49.79 
 
 
544 aa  445  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4458  metallophosphoesterase  45.31 
 
 
514 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1223  metallophosphoesterase  43.33 
 
 
546 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.148562  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1115  metallophosphoesterase  42.03 
 
 
526 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190762  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4366  metallophosphoesterase  37.82 
 
 
489 aa  337  3.9999999999999995e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4738  metallophosphoesterase  40 
 
 
513 aa  303  6.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.203482  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11330  predicted phosphohydrolase  35.16 
 
 
537 aa  261  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513687  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0868  metallophosphoesterase  34.98 
 
 
544 aa  259  8e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00146692  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1242  metallophosphoesterase  26.39 
 
 
499 aa  177  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.163167  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2226  hypothetical protein  25.49 
 
 
489 aa  170  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1472  metallophosphoesterase  26.46 
 
 
466 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.114222  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1715  metallophosphoesterase  30.37 
 
 
577 aa  90.1  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.942049  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2227  metallophosphoesterase  29.1 
 
 
699 aa  75.1  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1285  metallophosphoesterase  27.87 
 
 
474 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.645339  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13180  hypothetical protein  28.64 
 
 
635 aa  56.6  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0785963  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1653  metallophosphoesterase  32.74 
 
 
258 aa  56.2  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1743  metallophosphoesterase  23.24 
 
 
214 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.97747  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2238  metallophosphoesterase  27.24 
 
 
663 aa  54.7  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.771781  hitchhiker  0.00997519 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1571  metallophosphoesterase  27.21 
 
 
645 aa  54.7  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0992  metallophosphoesterase  24.73 
 
 
259 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.312522 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0508  metallophosphoesterase  32.46 
 
 
267 aa  50.4  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.236353  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1364  metallophosphoesterase  34.15 
 
 
321 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.793805  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5443  metallophosphoesterase  33.75 
 
 
324 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0193  metallophosphoesterase  34.57 
 
 
318 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.749364 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  32.14 
 
 
280 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  32.14 
 
 
275 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  32.14 
 
 
299 aa  45.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1218  metallophosphoesterase  25.45 
 
 
366 aa  44.7  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0970126  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3584  metallophosphoesterase  29.41 
 
 
258 aa  44.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5533  metallophosphoesterase  25.86 
 
 
246 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164819  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2672  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  25.42 
 
 
274 aa  43.9  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2620  metallophosphoesterase  28.32 
 
 
235 aa  43.9  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.534657  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0306  metallophosphoesterase  31.63 
 
 
312 aa  43.9  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.533332  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3442  exonuclease subunit SbcD  33.7 
 
 
483 aa  43.9  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289654  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3964  metallophosphoesterase  28.33 
 
 
258 aa  43.9  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  normal  0.285649 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1191  metallophosphoesterase  34.94 
 
 
283 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28829  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8888  metallophosphoesterase  30 
 
 
247 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>