22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4458 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4458  metallophosphoesterase  100 
 
 
514 aa  1013    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2852  putative integral membrane protein  61.64 
 
 
537 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0545  metallophosphoesterase  51.22 
 
 
544 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9057  hypothetical protein  47.7 
 
 
499 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3363  metallophosphoesterase  44.3 
 
 
532 aa  428  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1115  metallophosphoesterase  41.43 
 
 
526 aa  331  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190762  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1223  metallophosphoesterase  38.92 
 
 
546 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.148562  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4366  metallophosphoesterase  37.88 
 
 
489 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4738  metallophosphoesterase  41.07 
 
 
513 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.203482  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0868  metallophosphoesterase  37.05 
 
 
544 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00146692  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11330  predicted phosphohydrolase  35.73 
 
 
537 aa  240  5e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513687  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1242  metallophosphoesterase  28.85 
 
 
499 aa  169  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.163167  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1472  metallophosphoesterase  28.74 
 
 
466 aa  160  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.114222  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2226  hypothetical protein  25.28 
 
 
489 aa  141  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13180  hypothetical protein  32.74 
 
 
635 aa  73.6  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0785963  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1715  metallophosphoesterase  33.93 
 
 
577 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.942049  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1571  metallophosphoesterase  31.72 
 
 
645 aa  66.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2227  metallophosphoesterase  30.7 
 
 
699 aa  62.4  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2238  metallophosphoesterase  34.12 
 
 
663 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.771781  hitchhiker  0.00997519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1285  metallophosphoesterase  29.91 
 
 
474 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.645339  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1653  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
258 aa  47.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4019  metallophosphoesterase  33.15 
 
 
480 aa  44.3  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>