22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13180 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_13180  hypothetical protein  100 
 
 
635 aa  1254    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0785963  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1571  metallophosphoesterase  48.74 
 
 
645 aa  504  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2227  metallophosphoesterase  47.6 
 
 
699 aa  479  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2238  metallophosphoesterase  47.45 
 
 
663 aa  410  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.771781  hitchhiker  0.00997519 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1715  metallophosphoesterase  41.89 
 
 
577 aa  354  2e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.942049  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4019  metallophosphoesterase  31.42 
 
 
480 aa  101  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4738  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
513 aa  76.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.203482  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2852  putative integral membrane protein  32.52 
 
 
537 aa  75.1  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0545  metallophosphoesterase  29.56 
 
 
544 aa  74.7  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4458  metallophosphoesterase  32.44 
 
 
514 aa  73.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4366  metallophosphoesterase  31.08 
 
 
489 aa  73.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0868  metallophosphoesterase  35.29 
 
 
544 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00146692  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9057  hypothetical protein  27.74 
 
 
499 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1223  metallophosphoesterase  30.36 
 
 
546 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.148562  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2226  hypothetical protein  28.8 
 
 
489 aa  62.4  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1115  metallophosphoesterase  29.96 
 
 
526 aa  60.8  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190762  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11330  predicted phosphohydrolase  31.33 
 
 
537 aa  55.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513687  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1242  metallophosphoesterase  25.62 
 
 
499 aa  53.9  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.163167  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3363  metallophosphoesterase  31.3 
 
 
532 aa  51.6  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1285  metallophosphoesterase  29.03 
 
 
474 aa  45.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.645339  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05030  predicted phosphohydrolase  30.97 
 
 
726 aa  44.3  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1472  metallophosphoesterase  26.19 
 
 
466 aa  43.9  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.114222  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>