122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05030 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_05030  predicted phosphohydrolase  100 
 
 
726 aa  1446    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 
963 aa  70.1  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  21.57 
 
 
616 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  21.06 
 
 
611 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  23.95 
 
 
371 aa  61.6  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  24.79 
 
 
371 aa  60.8  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  27.7 
 
 
687 aa  60.8  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1299  metallophosphoesterase  24.85 
 
 
606 aa  60.1  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.15 
 
 
395 aa  58.9  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  25.15 
 
 
395 aa  58.9  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  26.14 
 
 
1812 aa  58.2  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  28.17 
 
 
365 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 
795 aa  57.8  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  24.83 
 
 
774 aa  57.4  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  23.68 
 
 
475 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 
619 aa  56.6  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  23.88 
 
 
265 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  26.11 
 
 
432 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  22.12 
 
 
445 aa  55.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2524  metallophosphoesterase  26.25 
 
 
314 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal  0.43864 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00590  predicted phosphohydrolase  30.53 
 
 
343 aa  54.3  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.632945  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3015  Pyrrolo-quinoline quinone  32.86 
 
 
416 aa  54.3  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  29.38 
 
 
383 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  27.57 
 
 
239 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  27.57 
 
 
239 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  22.93 
 
 
371 aa  53.1  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1670  metallophosphoesterase  25.87 
 
 
281 aa  53.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  27.57 
 
 
266 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 
611 aa  53.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  25.64 
 
 
431 aa  53.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1184  purple acid phosphatase family protein  25.37 
 
 
281 aa  52.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0863816  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1087  purple acid phosphatase family protein  25.37 
 
 
281 aa  52.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  27.85 
 
 
1454 aa  52  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  28.77 
 
 
458 aa  51.6  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.54 
 
 
393 aa  51.2  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  25.55 
 
 
463 aa  51.2  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2854  metallophosphoesterase  22.35 
 
 
382 aa  50.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.806939  decreased coverage  0.00466142 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  25.67 
 
 
643 aa  50.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0750  PQQ repeat-containing protein  23.35 
 
 
353 aa  49.3  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.137969  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  31.79 
 
 
448 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  45.21 
 
 
454 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  30.64 
 
 
454 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  29.18 
 
 
901 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  27.75 
 
 
245 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  26 
 
 
652 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  26.2 
 
 
439 aa  50.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  32.28 
 
 
546 aa  48.9  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.16 
 
 
380 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.78 
 
 
402 aa  49.3  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  28.14 
 
 
457 aa  48.9  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4329  metallophosphoesterase  21.83 
 
 
374 aa  48.9  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3588  metallophosphoesterase  23.2 
 
 
321 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  24.87 
 
 
270 aa  48.5  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1144  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  30.53 
 
 
391 aa  48.5  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  28.04 
 
 
363 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  33.33 
 
 
455 aa  48.1  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0865  Pyrrolo-quinoline quinone  23.27 
 
 
611 aa  48.1  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  26.37 
 
 
277 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  25.3 
 
 
379 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.29 
 
 
392 aa  47.8  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4551  metallophosphoesterase  25.49 
 
 
388 aa  47.8  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.341763 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  28.04 
 
 
363 aa  47.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.68 
 
 
385 aa  47.8  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  25.3 
 
 
653 aa  47.4  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3398  metallophosphoesterase  22.3 
 
 
304 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11944 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  23.33 
 
 
2122 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  28.63 
 
 
380 aa  47.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  28.26 
 
 
448 aa  47  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2979  hypothetical protein  25.26 
 
 
314 aa  47.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619955  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  27.68 
 
 
276 aa  47.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  24.11 
 
 
396 aa  47.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  23.63 
 
 
274 aa  47  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.78 
 
 
393 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  37.31 
 
 
461 aa  46.6  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  27.93 
 
 
514 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.78 
 
 
393 aa  46.6  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.78 
 
 
393 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  28.57 
 
 
402 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  24.32 
 
 
352 aa  46.6  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.38 
 
 
402 aa  46.2  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.35 
 
 
393 aa  46.2  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2672  metallophosphoesterase  24.88 
 
 
313 aa  45.8  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0337269  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4689  metallophosphoesterase  21.84 
 
 
319 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.596745  normal  0.125787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  28.2 
 
 
475 aa  45.8  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  25.6 
 
 
603 aa  45.4  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.140505  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27 
 
 
386 aa  45.8  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  26.28 
 
 
400 aa  45.8  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1544  metallophosphoesterase  25.73 
 
 
395 aa  45.4  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4196  metallophosphoesterase  25.77 
 
 
292 aa  45.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2304  Pyrrolo-quinoline quinone  26.97 
 
 
379 aa  45.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.262022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  22.54 
 
 
275 aa  45.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  27.74 
 
 
387 aa  45.4  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1817  Pyrrolo-quinoline quinone  23.15 
 
 
400 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.216395  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.88 
 
 
392 aa  45.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.38 
 
 
392 aa  45.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4746  metallophosphoesterase  25.73 
 
 
274 aa  45.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0884  Pyrrolo-quinoline quinone  29.94 
 
 
342 aa  45.4  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0837922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  32.9 
 
 
372 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  21.17 
 
 
322 aa  45.1  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1065  metallophosphoesterase  29.06 
 
 
1327 aa  45.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>