24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2226 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2226  hypothetical protein  100 
 
 
489 aa  984    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1242  metallophosphoesterase  33.47 
 
 
499 aa  274  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.163167  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1472  metallophosphoesterase  29.22 
 
 
466 aa  186  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.114222  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3363  metallophosphoesterase  25.49 
 
 
532 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4366  metallophosphoesterase  27.01 
 
 
489 aa  163  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0545  metallophosphoesterase  28.36 
 
 
544 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9057  hypothetical protein  26.45 
 
 
499 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2852  putative integral membrane protein  26.77 
 
 
537 aa  150  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4738  metallophosphoesterase  28.21 
 
 
513 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.203482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1115  metallophosphoesterase  24.64 
 
 
526 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190762  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1223  metallophosphoesterase  26.67 
 
 
546 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.148562  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4458  metallophosphoesterase  26.3 
 
 
514 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0868  metallophosphoesterase  26.85 
 
 
544 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00146692  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11330  predicted phosphohydrolase  22.7 
 
 
537 aa  94  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513687  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1285  metallophosphoesterase  28.43 
 
 
474 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.645339  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13180  hypothetical protein  28.8 
 
 
635 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0785963  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1571  metallophosphoesterase  31.19 
 
 
645 aa  61.6  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1715  metallophosphoesterase  29.8 
 
 
577 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.942049  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4019  metallophosphoesterase  25.4 
 
 
480 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2227  metallophosphoesterase  29.74 
 
 
699 aa  57.4  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2238  metallophosphoesterase  31.74 
 
 
663 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.771781  hitchhiker  0.00997519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1653  metallophosphoesterase  29.95 
 
 
258 aa  47  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3968  metallophosphoesterase  25.58 
 
 
207 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0508  metallophosphoesterase  23.67 
 
 
267 aa  44.3  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.236353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>