78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1653 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1653  metallophosphoesterase  100 
 
 
258 aa  518  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2768  metallophosphoesterase  52.28 
 
 
240 aa  250  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2865  metallophosphoesterase  53.54 
 
 
235 aa  246  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0711307  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5533  metallophosphoesterase  50 
 
 
246 aa  239  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164819  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0482  metallophosphoesterase  57.2 
 
 
240 aa  239  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0161  metallophosphoesterase  52.54 
 
 
251 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1703  metallophosphoesterase  56.78 
 
 
240 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0442021  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0143  metallophosphoesterase  51.69 
 
 
250 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4056  metallophosphoesterase  48.74 
 
 
236 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0150  metallophosphoesterase  55.98 
 
 
212 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0148  metallophosphoesterase  49.33 
 
 
270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0125626  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0890  hypothetical protein  45 
 
 
244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3964  metallophosphoesterase  42.11 
 
 
258 aa  175  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  normal  0.285649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3584  metallophosphoesterase  41.23 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0573  metallophosphoesterase  46.32 
 
 
254 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0332  metallophosphoesterase  44.74 
 
 
291 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7900  hypothetical protein  44.3 
 
 
237 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16850  predicted phosphoesterase, ICC  45.23 
 
 
237 aa  158  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.352098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1800  metallophosphoesterase  41.3 
 
 
247 aa  158  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6480  metallophosphoesterase  44.17 
 
 
249 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.246968  normal  0.0842376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2740  metallophosphoesterase  42.11 
 
 
242 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.446767  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0306  metallophosphoesterase  42.38 
 
 
312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.533332  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0815  metallophosphoesterase  28.38 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.983977  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1524  metallophosphoesterase  28.7 
 
 
221 aa  63.5  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.226275 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0778  metallophosphoesterase  23.86 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0994  metallophosphoesterase  24.89 
 
 
253 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00045494  normal  0.0505337 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0740  metallophosphoesterase  27.27 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00061075  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3363  metallophosphoesterase  32.74 
 
 
532 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0545  metallophosphoesterase  37.17 
 
 
544 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0128  metallophosphoesterase  36.59 
 
 
274 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695982  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09720  metallophosphoesterase  26.47 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4366  metallophosphoesterase  31.43 
 
 
489 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1687  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
239 aa  52.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9057  hypothetical protein  36.19 
 
 
499 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1716  metallophosphoesterase  25.49 
 
 
235 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0725169  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0260  metallophosphoesterase  26.43 
 
 
228 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4446  metallophosphoesterase  29.44 
 
 
387 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0620  Ser/Thr protein phosphatase family protein  21.21 
 
 
230 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000754681  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0634  Ser/Thr protein phosphatase family protein  21.21 
 
 
230 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000320129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  30.32 
 
 
274 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1345  metallophosphoesterase  24.48 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.186461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0808  metallophosphoesterase  21.13 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1990  metallophosphoesterase  34 
 
 
747 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4458  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
514 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3826  metallophosphoesterase  26.57 
 
 
366 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2226  hypothetical protein  29.95 
 
 
489 aa  47  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3876  metallophosphoesterase  26.57 
 
 
366 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  27.06 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.24 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  26.46 
 
 
266 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2363  metallophosphoesterase  31.82 
 
 
274 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000361854 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1115  metallophosphoesterase  28.49 
 
 
526 aa  45.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190762  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3492  metallophosphoesterase  23.87 
 
 
297 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00129162  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.64 
 
 
354 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  55 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.23 
 
 
325 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0346  metallophosphoesterase  22.96 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.27 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.27 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.27 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  28.27 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1472  metallophosphoesterase  38.16 
 
 
466 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.114222  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4738  metallophosphoesterase  29.66 
 
 
513 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.203482  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.27 
 
 
275 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1325  metallophosphoesterase  34.04 
 
 
270 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2182  metallophosphoesterase  31.19 
 
 
257 aa  43.5  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00235018  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1223  metallophosphoesterase  29.2 
 
 
546 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.148562  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2057  metallophosphoesterase  26.69 
 
 
313 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1331  metallophosphoesterase  27.81 
 
 
215 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.174892  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1924  metallophosphoesterase  35.51 
 
 
230 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0467671 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  26.29 
 
 
275 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1934  hypothetical protein  29.58 
 
 
270 aa  42.4  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  29.63 
 
 
428 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0745  metallophosphoesterase  24.35 
 
 
342 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  44.19 
 
 
270 aa  42.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  34.12 
 
 
357 aa  42.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  35 
 
 
290 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0730  metallophosphoesterase  27.4 
 
 
243 aa  42  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>