65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16850 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_16850  predicted phosphoesterase, ICC  100 
 
 
237 aa  470  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.352098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3964  metallophosphoesterase  66.95 
 
 
258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  normal  0.285649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3584  metallophosphoesterase  65.68 
 
 
258 aa  298  5e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1800  metallophosphoesterase  69.62 
 
 
247 aa  296  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0332  metallophosphoesterase  63.68 
 
 
291 aa  268  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0573  metallophosphoesterase  61.67 
 
 
254 aa  256  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7900  hypothetical protein  60.85 
 
 
237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0890  hypothetical protein  59.07 
 
 
244 aa  249  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2740  metallophosphoesterase  55.51 
 
 
242 aa  241  9e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.446767  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6480  metallophosphoesterase  59.49 
 
 
249 aa  238  8e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.246968  normal  0.0842376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2768  metallophosphoesterase  45.15 
 
 
240 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0148  metallophosphoesterase  45.65 
 
 
270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0125626  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1653  metallophosphoesterase  45.23 
 
 
258 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4056  metallophosphoesterase  43.7 
 
 
236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2865  metallophosphoesterase  41.25 
 
 
235 aa  177  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0711307  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5533  metallophosphoesterase  41.63 
 
 
246 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164819  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0161  metallophosphoesterase  41.67 
 
 
251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0143  metallophosphoesterase  40.79 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0482  metallophosphoesterase  44.12 
 
 
240 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1703  metallophosphoesterase  43.28 
 
 
240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0442021  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0150  metallophosphoesterase  43.35 
 
 
212 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0306  metallophosphoesterase  40.58 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.533332  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0815  metallophosphoesterase  29.91 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.983977  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0740  metallophosphoesterase  26.75 
 
 
238 aa  63.2  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00061075  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1524  metallophosphoesterase  29.95 
 
 
221 aa  59.3  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.226275 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0260  metallophosphoesterase  25.24 
 
 
228 aa  55.8  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3391  metallophosphoesterase  25.23 
 
 
363 aa  48.9  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119138  normal  0.040425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  27.11 
 
 
357 aa  48.9  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0959  metallophosphoesterase  40.28 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07391  putative transcripton factor  27.05 
 
 
296 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2069  metallophosphoesterase  27.69 
 
 
403 aa  47.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00924522  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2057  metallophosphoesterase  43.21 
 
 
313 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2542  metallophosphoesterase  32.65 
 
 
379 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0138469  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1002  metallophosphoesterase  20.33 
 
 
249 aa  46.6  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1981  metallophosphoesterase  37.5 
 
 
273 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3588  metallophosphoesterase  29.82 
 
 
321 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0337  phospodiesterase  37.5 
 
 
273 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.669687  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0113  putative transcripton factor  26.64 
 
 
296 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.142539  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0339  metallophosphoesterase  27.87 
 
 
221 aa  45.4  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0897854  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1644  metallophosphoesterase  33.64 
 
 
249 aa  45.4  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755879  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2185  metallophosphoesterase  28.46 
 
 
260 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0736543  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1562  metallophosphoesterase  33.72 
 
 
369 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1456  metallophosphoesterase  32.56 
 
 
361 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.75 
 
 
277 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  33.75 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  31.71 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2858  metallophosphoesterase  23.62 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00208022  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  40.3 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2460  metallophosphoesterase  36.45 
 
 
356 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.301721 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6056  metallophosphoesterase  31.82 
 
 
366 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.107518 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  34.44 
 
 
380 aa  43.9  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3276  metallophosphoesterase  31.53 
 
 
277 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1345  metallophosphoesterase  26.83 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.186461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2675  metallophosphoesterase  31.82 
 
 
395 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.477016  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4142  metallophosphoesterase  27.02 
 
 
258 aa  42.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.377726  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  29.89 
 
 
415 aa  42.7  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5234  metallophosphoesterase  33.59 
 
 
313 aa  42.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.108734  normal  0.0791546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4744  metallophosphoesterase  27.68 
 
 
299 aa  42.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.158443 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0109  metallophosphoesterase  31.52 
 
 
285 aa  42.4  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4158  metallophosphoesterase  40.32 
 
 
364 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1325  metallophosphoesterase  22.83 
 
 
270 aa  42  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
270 aa  42  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1623  metallophosphoesterase  22.18 
 
 
411 aa  42  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2380  metallophosphoesterase  36.11 
 
 
262 aa  42  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0169412  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  35.71 
 
 
277 aa  41.6  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>