173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0128 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0128  metallophosphoesterase  100 
 
 
274 aa  564  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695982  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0173  metallophosphoesterase  76.28 
 
 
273 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0094  metallophosphoesterase  40.86 
 
 
268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532674  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0184  metallophosphoesterase  39.68 
 
 
253 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3554  hypothetical protein  39.18 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0127  metallophosphoesterase  36.15 
 
 
274 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3152  metallophosphoesterase  35 
 
 
274 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.495281  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0172  metallophosphoesterase  34.62 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2784  metallophosphoesterase  32.08 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.006766  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  38.19 
 
 
286 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0346  metallophosphoesterase  32.09 
 
 
282 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  36.54 
 
 
275 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  30.38 
 
 
287 aa  102  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  37.89 
 
 
289 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  31.82 
 
 
275 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  36.87 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.56 
 
 
277 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  31.36 
 
 
275 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  34.18 
 
 
286 aa  95.9  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.82 
 
 
275 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  29.82 
 
 
275 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.82 
 
 
275 aa  95.5  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.82 
 
 
275 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.82 
 
 
354 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  30.56 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.82 
 
 
325 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.82 
 
 
275 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  30.14 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  29.2 
 
 
276 aa  92.8  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.49 
 
 
274 aa  92.4  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  32.39 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  33 
 
 
274 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  31.05 
 
 
290 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  32.98 
 
 
239 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  32.98 
 
 
239 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0698  metallophosphoesterase  32.88 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  29.29 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  32.72 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0749  metallophosphoesterase  34.13 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1204  metallophosphoesterase  34.13 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189904  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1230  metallophosphoesterase  34.13 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215951  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1455  metallophosphoesterase  32.3 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0445506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1414  metallophosphoesterase  31.42 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.314571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0561  metallophosphoesterase  31.16 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1795  hypothetical protein  32.74 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.0189178 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1113  metallophosphoesterase  33.53 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  29.55 
 
 
274 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  27.71 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  28.31 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3490  metallophosphoesterase  29.61 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1112  metallophosphoesterase  32.93 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1783  metallophosphoesterase  30.85 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  27.88 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4534  metallophosphoesterase  29.9 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  27.8 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  29.76 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6665  metallophosphoesterase  33.03 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0199222  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
270 aa  79  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  27.45 
 
 
275 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10820  hypothetical protein  31.36 
 
 
318 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190676 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3506  metallophosphoesterase  30.7 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  29.17 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0979  metallophosphoesterase  34.64 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0549  metallophosphoesterase  30.21 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  29.95 
 
 
278 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3876  metallophosphoesterase  30 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5850  hypothetical protein  30.64 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248293  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  28.38 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2836  metallophosphoesterase  30.73 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.214717  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0606  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  28.12 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0581  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  24.53 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1599  metallophosphoesterase  34.36 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.265595  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4917  icc protein  29.17 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  25.09 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  28.16 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1772  ICC (3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase) protein  32.39 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131867  normal  0.0325302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4793  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  28.35 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0651  metallophosphoesterase  28.08 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4965  Ser/Thr protein phosphatase  27.75 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  28.84 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5698  hypothetical protein  27.6 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3291  metallophosphoesterase  30.08 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00054104  normal  0.0184462 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  26.89 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4970  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  27.6 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0756  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  29.35 
 
 
279 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  hitchhiker  0.00582637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65690  hypothetical protein  27.46 
 
 
272 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  25.51 
 
 
280 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  25.51 
 
 
275 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3233  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  28.5 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.848486  hitchhiker  0.00000281394 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  25.51 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4265  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.13 
 
 
275 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0728  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  28 
 
 
279 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.799636  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3358  cyclic AMP phosphodiesterase  25.38 
 
 
278 aa  62.4  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0573033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1191  metallophosphoesterase  28.92 
 
 
247 aa  62.4  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4709  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  32.26 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.771801 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0809  Calcineurin phosphoesterase domain protein  29.29 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  unclonable  0.00000000000233524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3575  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  29.29 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0784  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  29.29 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.611583  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3774  Calcineurin phosphoesterase domain protein  26.02 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0816  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  29.29 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103731  normal  0.395861 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>