92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4056 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4056  metallophosphoesterase  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2768  metallophosphoesterase  67.66 
 
 		 240 aa  348  5e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1703  metallophosphoesterase  67.38 
 
 		 240 aa  294  9e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0442021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0482  metallophosphoesterase  66.52 
 
 		 240 aa  290  9e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5533  metallophosphoesterase  49.38 
 
 		 246 aa  228  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1653  metallophosphoesterase  48.74 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2865  metallophosphoesterase  48.91 
 
 		 235 aa  218  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0711307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0143  metallophosphoesterase  45.87 
 
 		 250 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0161  metallophosphoesterase  42.37 
 
 		 251 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0148  metallophosphoesterase  43.4 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0125626  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3584  metallophosphoesterase  42.62 
 
 		 258 aa  175  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0150  metallophosphoesterase  45.02 
 
 		 212 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3964  metallophosphoesterase  40.93 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  normal  0.285649 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2740  metallophosphoesterase  44.54 
 
 		 242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.446767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16850  predicted phosphoesterase, ICC  43.7 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.352098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7900  hypothetical protein  42.62 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0332  metallophosphoesterase  41.35 
 
 		 291 aa  158  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0573  metallophosphoesterase  45.54 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0890  hypothetical protein  40.93 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6480  metallophosphoesterase  40.51 
 
 		 249 aa  154  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.246968  normal  0.0842376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1800  metallophosphoesterase  43.44 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0306  metallophosphoesterase  34.76 
 
 		 312 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.533332  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0815  metallophosphoesterase  24.77 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.983977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0778  metallophosphoesterase  24.17 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2858  metallophosphoesterase  25.64 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00208022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1345  metallophosphoesterase  24.79 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.186461 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1524  metallophosphoesterase  27.97 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.226275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  28.97 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0740  metallophosphoesterase  24 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00061075  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1508  metallophosphoesterase  25.4 
 
 		 241 aa  52.4  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.15726 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2606  metallophosphoesterase  25.1 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  25.47 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0863  metallophosphoesterase  26.69 
 
 		 255 aa  48.9  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09720  metallophosphoesterase  23.65 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1203  metallophosphoesterase  25.24 
 
 		 226 aa  48.9  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  26.42 
 
 		 418 aa  48.5  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2142  metallophosphoesterase  28.36 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.5 
 
 		 277 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  32.5 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1644  metallophosphoesterase  32.38 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3715  metallophosphoesterase  26.19 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.715212  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  26.74 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0545  metallophosphoesterase  33.93 
 
 		 544 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2854  metallophosphoesterase  21.43 
 
 		 382 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.806939  decreased coverage  0.00466142 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  32.14 
 
 		 275 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1687  metallophosphoesterase  24.58 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  25.58 
 
 		 285 aa  45.8  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1410  metallophosphoesterase  28.28 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000149653  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0821  hypothetical protein  32.73 
 
 		 158 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0961  phosphoesterase  32.73 
 
 		 158 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.286204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2872  metallophosphoesterase  24.05 
 
 		 292 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2185  metallophosphoesterase  26.53 
 
 		 260 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0736543  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5429  metallophosphoesterase  28.09 
 
 		 254 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2057  metallophosphoesterase  29.07 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01360  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.94 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  29.27 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2620  metallophosphoesterase  31.3 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.534657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  24.22 
 
 		 286 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1005  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 631 aa  45.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000460676  hitchhiker  0.000515762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5850  hypothetical protein  35.71 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248293  normal  0.559012 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0260  metallophosphoesterase  24.75 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  24.62 
 
 		 332 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4844  metallophosphoesterase  28.18 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1472  metallophosphoesterase  28.97 
 
 		 466 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.114222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2298  Calcineurin phosphoesterase domain protein  27.17 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1299  metallophosphoesterase  23.83 
 
 		 606 aa  43.5  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3418  metallophosphoesterase  29.59 
 
 		 307 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04070  Metallophosphoesterase  25.21 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529972  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0634  Ser/Thr protein phosphatase family protein  20.18 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000320129  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1706  phosphohydrolase  25.49 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000325339  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  23.11 
 
 		 289 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4329  metallophosphoesterase  23.15 
 
 		 374 aa  42.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0808  metallophosphoesterase  23.31 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3577  metallophosphoesterase  26.34 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00161891  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0620  Ser/Thr protein phosphatase family protein  20.36 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000754681  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  29.27 
 
 		 276 aa  42.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0061  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  21.21 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2182  metallophosphoesterase  26.32 
 
 		 257 aa  42.4  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00235018  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4151  metallophosphoesterase  29.41 
 
 		 381 aa  42.4  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0073  metallophosphoesterase  34.57 
 
 		 619 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  27.36 
 
 		 421 aa  42.4  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3359  metallophosphoesterase  29.7 
 
 		 385 aa  42.4  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3446  metallophosphoesterase  34.71 
 
 		 282 aa  42.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0953452 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2542  metallophosphoesterase  25.95 
 
 		 379 aa  42  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0138469  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  27.27 
 
 		 382 aa  42  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0346  metallophosphoesterase  23.14 
 
 		 282 aa  42  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0186  metallophosphoesterase  28.46 
 
 		 403 aa  42  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  37.04 
 
 		 270 aa  42  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1166  metallophosphoesterase  28.97 
 
 		 230 aa  42  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000802576 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5903  metallophosphoesterase  34.18 
 
 		 276 aa  42  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  32.93 
 
 		 275 aa  42  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1168  metallophosphoesterase  25.89 
 
 		 213 aa  41.6  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>